スタン・
ここからダウンロードできるStanドキュメントを調べていました。Gelman-Rubin診断の実装に特に興味がありました。元の論文Gelman&Rubin(1992)は、潜在的な縮尺率(PSRF)を次のように定義しています。 ましょうであるサンプリング番目のマルコフ連鎖、および全体的な存在であるとするサンプリング独立チェーン。ましょうから平均する番目の鎖、及び全体平均です。定義、 ここで そして、定義Xi,1,…,Xi,NXi,1,…,Xi,NX_{i,1}, \dots , X_{i,N}iiiMMMX¯i⋅X¯i⋅\bar{X}_{i\cdot}ˉ X ⋅ ⋅ W = 1iiiX¯⋅⋅X¯⋅⋅\bar{X}_{\cdot \cdot}s 2 m =1W=1M∑m=1Ms2m,W=1M∑m=1Msm2,W = \dfrac{1}{M} \sum_{m=1}^{M} {s^2_m}, B B = Ns2m=1N−1∑t=1N(X¯mt−X¯m⋅)2.sm2=1N−1∑t=1N(X¯mt−X¯m⋅)2.s^2_m = \dfrac{1}{N-1} \sum_{t=1}^{N} (\bar{X}_{m t} - \bar{X}_{m \cdot})^2\,. BBB B=NM−1∑m=1M(X¯m⋅−X¯⋅⋅)2.B=NM−1∑m=1M(X¯m⋅−X¯⋅⋅)2.B = \dfrac{N}{M-1} \sum_{m=1}^{M} (\bar{X}_{m \cdot} - \bar{X}_{\cdot \cdot})^2 \,. 定義 PSRFはで推定されここで ここで、。√V^=(N−1N)W+(M+1MN)B.V^=(N−1N)W+(M+1MN)B.\hat{V} = \left(\dfrac{N-1}{N} \right)W …