Rの2因子反復測定ANOVA後の事後検定?
Rで2因子(両方とも被験者内)のANOVAを繰り返し測定した後、事後テスト(Tukey HSD)を実行する方法に関する解決策を見つけるのに問題があります。ANOVAには、aov -functionを使用しました。 summary(aov(dv ~ x1 * x2 + Error(subject/(x1*x2)), data=df1)) 他の質問への回答を読んだ後、他の機能(lmeなど)を使用してANOVAを再実行する必要があることを知りました。これが私が思いついたものです。 Lme.mod <- lme(dv ~ x1*x2, random=list(subject=pdBlocked(list(~1, pdIdent(~x1-1), pdIdent(~x2-1)))), data=df1) anova(Lme.mod) 主な効果はどちらも有意でしたが、相互作用の効果はありませんでした。次に、これらの関数を事後比較に使用しました。 summary(glht(Lme.mod, linfct=mcp(x1="Tukey"))) summary(glht(Lme.mod, linfct=mcp(x2="Tukey"))) しかし、いくつかの問題がありました: まず、Rヘルプファイルには、「双方向ANOVAまたはANCOVAモデル(...)multcompバージョン1.0-0以降で対象のパラメーターを定義する場合、mcp関数は注意して使用する必要があります。主な効果の比較が生成されます。のみ、共変量と交互作用を無視します(古いバージョンは交互作用項で自動的に平均化されました)警告が表示されます。そして確かに、私は次の警告メッセージを受け取りました: Warning message: In mcp2matrix(model, linfct = linfct) : covariate interactions found -- default contrast might be inappropriate もう1つの不可解な点は、両方の主要な効果は有意でしたが、要因の1つ(x1)の事後比較に有意差はなかったということです。これに出会ったことはありません。スクリプト/分析は正しい/適切ですか、それとも欠けているものはありますか?どんな助けでも大歓迎です!