1
ビーガンのアドニス:変数の順序または階層の使用
パッケージadonis()内の関数を使用して、vegan1)共生する宿主種が複数のサイト間で微生物群集で異なるかどうか、および2)サイトが異なるかどうかを決定しています。CVとSOに関するすべての投稿を調べましたが、アドニス機能を使用して複数の要因の重要性を判断する方法に対する明確な答えはありません。 /programming/26768779/vegan-adonis-unbalanced-design-ss-type-ii-or-iiiで提案されているように、私は最初にこれを行いました: ここで、jaccはジャカードメトリックを使用した非類似度行列です adonis <- adonis(jacc ~ Species + Site, data = df_compare) adonis Call: adonis(formula = jacc ~ Species + Site, data = df_compare) Permutation: free Number of permutations: 999 Terms added sequentially (first to last) Df SumsOfSqs MeanSqs F.Model R2 Pr(>F) Species 2 0.6055 0.30273 1.7690 0.04981 0.004 …