Windowsのインストール後のファイルを削除しても安全ですか？

最初のパーティションにWindows XPがインストールされていて、2番目のパーティションが空です。外付けハードドライブも接続しました。2番目のパーティションにWindows Vistaをインストールしましたが、外付けハードドライブに、アクセスする権限のない奇妙なファイルがいくつかあります。それらのファイルとは何ですか？それらを削除しても安全ですか？

はい、削除しても安全です。それらを削除する前に、所有権を取得する必要があります（その後、アクセス許可を変更する必要があります）。

所有権の取得については、こちらをご覧ください：http : //www.vistax64.com/tutorials/67717-take-ownership-file.html