複数の言語（RやSplusなど）を含む統計プロジェクトのディレクトリ構造？

投稿の構築統計分析プロジェクトとR の ProjectTemplateパッケージを効率的に管理する方法 ...

Q：複数の言語が大きく機能している場合（R AND Splusなど）、統計プロジェクトのディレクトリ構造をどのように構築しますか？

このトピックに関するほとんどの議論は、主に1つの言語を使用するプロジェクトに限定されています。複数の言語を使用しているときに、だらし、混乱、破損を最小限に抑える方法に関心があります。

以下に、現在のプロジェクト構造と実行方法を示します。代替は私が持っているので、別々のコードにあるかもしれない./Rし、./Splusディレクトリ---それぞれ含む、独自の/lib、/src、/util、/tests、および/mungeディレクトリ。

Q：「ベストプラクティス（存在する場合）」に最も近いアプローチはどれですか。

• / data-プロジェクト間で共有されるデータ
• / libraries-プロジェクト間で共有されるスクリプト
• / projects / myproject-私の作業ディレクトリ。現在、複数の言語を使用している場合は、この場所を作業ディレクトリとして共有しています。
• ./data/-データに固有のデータとデータへの/myprojectシンボリックリンク/data
• ./cache/ -キャッシュされたワークスペース（例えば、.RDataファイルを使用して保存されたsave.image()Rまたはに.sddファイルを使用して保存されたdata.dump()S-PLUSで）
• ./lib/-メインプロジェクトファイル。すべてのプロジェクトで同じです。Rプロジェクトが実行されます経由source("./lib/main.R")今度の実行中にload.R、clean.R、test.R、analyze.R、.report.R。複数の言語が使用されている場合、現在、たとえば、S-PLUSは、Rに加えて、私がスローされますmain.ssc、clean.sscこのディレクトリに、などにも。私はこれが好きかどうかわからない。
• ./src/-プロジェクト固有の関数。ファイルごとに1つの関数を収集しました。
• ./util/-最終的にパッケージ化される一般的な関数。ファイルごとに1つの関数を収集しました。
• ./tests/-テストケースを実行するためのファイル。によって使われた./lib/test.R
• ./munge/-データをクリーニングするためのファイル。によって使われた./lib/clean.R
• ./figures/-./lib/report.R最終レポートで使用される表と図の出力
• ./report/ - .texファイルへのファイルやシンボリックリンクで./figures
• ./presentation/ - .texプレゼンテーション用のファイル（通常はBeamerクラス）
• ./temp/-一時スクリプトの場所
• ./README
• ./TODO
• ./.RData-Rプロジェクトワークスペースを格納する
• ./.Data/-Sプロジェクトワークスペースを格納するため

私は間違いなく「ベストプラクティス」とは言いませんが、私の典型的なプロジェクトにはディレクトリがあります

R（一般的に含まれprepData.R、analysis.R、func.R、とfigs.R、しかしこれらは、多くのファイルにそれぞれ分割することができかもしれないとはSweaveまたは使用することができasciidocを）

Perl （主にデータファイルの解析/変換用）

RawData （すべての元のデータファイル）

Data （すべての処理済みファイル）

Notes （通常、共同編集者からのメモ）

Rディレクトリには、多くの場合、サブディレクトリが含まれていますFigsとRcache。

特に重要：バージョン管理！私はgitが好きです。