grepへの検索用語（ファイル名ではない）のパイピング

ファイルから特定の番号を含む特定の行を取り出したい。検索したいファイルはと呼ばれos_clusters/piRNA_clusters.bedます。

awk '{if (a[$0]++ == 0) {split($0,b,"."); ;split(b[1],c,"r"); print c[3]}};' test_non_enriched | xargs grep {} os_clusters/piRNA_clusters.bed

パイプの前の最初の部分は機能します。8707、8824など、検索する用語を生成します。ただし、後者は機能しません。

awk '' ... | xargs grep {} os_clusters/piRNA_clusters.bed

パイプによって生成された用語をターゲットファイルで検索する代わりに、検索用語を入力ファイルと見なします。したがって、次のようなエラーメッセージが表示されます。

grep: 8707: No such file or directory
grep: 8824: No such file or directory

os_clusters/piRNA_clusters.bedパイプによって生成された用語をファイルで検索するには、何を変更する必要がありますか？

欲しいと思う

... | grep -f - os_clusters/piRNA_clusters.bed

-f伝えgrepファイルから検索パターンを取得し、-このファイルが実際に（あなたのケースでは、パイプの出力）を標準入力されていることを伝えます。

@riciのコメントのおかげで、GNU以外でのgrep使用について

... | grep -f /dev/stdin os_clusters/piRNA_clusters.bed