ファイルからgrepパターンを読み取る

いくつかの大きなテキストファイルがあり、そのファイルUNIQS.txtにはgrep別のファイルからの文字列のリストがあります。私が使用するコードは

grep -f UNIQS.txt EEP_VSL.uniqs.sam > UNIQ_templates.sam

何もしません-生成されたファイルは空です。しかし、私がするとき

grep -F -f UNIQS.txt EEP_VSL.uniqs.sam > UNIQ_templates.sam

正しく機能します。これは、ファイル内にクォートやスラッシュなどのない正規表現パターンとしてgrepエントリを解釈するとは思わなかったので、私を混乱させUNIQS.txtます（そうではありません）。一般に、ファイルからパターンを取得している場合、正規表現パターンであると自動的に判断されるのでしょうか？

編集：ではUNIQS.txt、ファイル、フォームの改行で区切られた文字列があります

HWI-ST365:215:D0GH0ACXX:2:1101:10034:186783

（テンプレート名と呼ばれます）およびファイルEEP_VSL...タブで区切られた列で、約14列と最初の列がテンプレート名であるため、基本的にファイル内の各テンプレートに対応する行を抽出します。

この-fオプションは、grepがパターンを読み取るファイルを指定します。これは、コマンドラインでパターンを渡すのと同じです（-e複数ある場合はオプションを使用します）。ただし、シェルから呼び出すときは、パターンを引用符で囲む必要があり、その特殊文字がシェルによって展開されないようにします。

引数-Eor -Fまたは-P（ある場合）は、grepにパターンが記述されている構文を伝えます。引数がない場合、grepは基本的な正規表現を期待します。で-E、grepは拡張正規表現を期待します。-P（サポートされている場合）、grepのを期待は、正規表現をPerlの。そして-F、grepはリテラル文字列を期待します。パターンがコマンドラインから来たのかファイルから来たのかは関係ありません。

文字列は部分文字列であることに注意してください。a+bパターンとして渡すと、含む行a+b+cが一致します。指定された文字列の1つだけを含む行を検索する場合は、-xオプションを渡します。

私は同じエラーを抱えていましたが、@ gillesからの良い答えでは解決しませんでした。入力ファイルをよく見ると、最後に2つの改行が見つかりました。これらがなければ、成功、必要なのはgrep -i file_pattern_input file

（GNU grep 3.1、入力ファイル5000件を超えるレコード、マッチング/パターンファイル2536、すべての2536がファイル内に存在する必要があることはわかっていました。