同じヘッダーとその下の異なるベクターを持つ複数のファイルがあります。それらをすべて連結する必要がありますが、最初のファイルのヘッダーのみを連結し、他のヘッダーはすべて同じであるため連結しないようにします。

例：file1.txt

<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B 
C

file2.txt

<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
D
E 
F

出力が必要です

<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B
C
D
E 
F

Rでスクリプトを記述できますが、シェルでそれが必要ですか？

Rでそれを行う方法を知っている場合は、必ずRでそれを行ってください。古典的なUNIXツールでは、これは最も自然にawkで行われます。

awk '
    FNR==1 && NR!=1 { while (/^<header>/) getline; }
    1 {print}
' file*.txt >all.txt

awkスクリプトの最初の行は、ファイルの最初の行（FNR==1）と一致しますが、すべてのファイルの最初の行（NR==1）でもある場合を除きます。これらの条件が満たされると、式while (/^<header>/) getline;が実行されます。これにより、awkは、現在の行がregexpに一致する限り、別の行の読み取りを続けます（現在の行をスキップします）^<header>。awkスクリプトの2行目は、以前にスキップされた行を除くすべてを印刷します。

cat+grep上記の" " に似た別のソリューションで、tailand を使用しheadます。

1. 最初のファイルのヘッダーを出力に書き込みます。

   head -2 file1.txt > all.txt

   - head -2ファイルの最初の2行を取得します。

2. すべてのファイルのコンテンツを追加します。

   tail -n +3 -q file*.txt >> all.txt

   -は-n +3なりtail、最後まで3から印刷行を -qファイル名（リードを持つヘッダを印刷しないことを指示man） >>しないように、それを上書きし、ファイルに追加します>。

そして、両方のコマンドを1行で入力できることを確認してください。

head -2 file1.txt > all.txt; tail -n +3 -q file*.txt >> all.txt

または成功チェックのためにそれらの間に;置く代わりに&&。

これを試してみてください：

$ cat file1.txt; grep -v "^<header" file2.txt
<header>INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer>
<header>INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer>
A
B 
C
D
E 
F

注意

• -v一致反転するフラグ手段はgrepを
• ^でREGEX、手段は、文字列の先頭
• たくさんのファイルがあれば、できます

：

array=( files*.txt )
{ cat ${array[@]:0:1}; grep -v "^<header" ${array[@]:1}; } > new_file.txt

これは、bash配列のスライス手法です。

tail（GNU、少なくとも上の）コマンドは、最初の行の所定数をスキップするオプションを有します。2行目以降の印刷、つまり1行のヘッダーをスキップするには、次のようにします。tail -n+2 myfile

したがって、最初のファイルの2行ヘッダーを保持し、2番目のファイルは保持しないようにするには、Bashで：

cat file1.txt <(tail -n+3 file2.txt) > combined.txt

または、多くのファイルの場合：

head -n1 file1.txt > combined.txt
for fname in *.txt
do
    tail -n+3 $fname >> combined.txt
done

特定の文字列がすべてのヘッダー行に存在することがわかっているが、残りの入力ファイルにgrep -vは存在しない場合、sputnikが示したように、より単純なアプローチです。

短い（必ずしも高速ではない）sed：

sed -e '3,${/^<header>/d' -e '}' file*.txt > all.txt

これにより<header>...、3行目から始まるすべての行が削除されるため、最初のヘッダーが保持され、他のヘッダーは削除されます。ヘッダーの行数が異なる場合は、それに応じてコマンドを調整します（たとえば、6行ヘッダーの7代わりに使用します3）。
ヘッダーの行数が不明な場合は、次のようにしてみてください。

sed '1{
: again
n
/^<header>/b again
}
/^<header>/d
' file*.txt > all.txt

array =（* .txt）; head -1 $ {array [0]}> all.txt; tail -n +2 -q $ {array [@]：0} >> all.txt

結合/連結する必要のある同じヘッダーを持つ.txtファイルを含むフォルダーを使用しているとすると、このコードは、txtファイルをすべて1つのヘッダーを持つall.txtに結合します。最初の行（セミコロンで区切られた行）は連結するすべてのテキストファイルを収集し、2行目は最初のtxtファイルのヘッダーをall.txtに出力し、最後の行はヘッダーなしで収集されたすべてのテキストファイルを連結します（ 2行目以降の連結）とall.txtに追加します。