共通のヘッダーを使用して2つのファイルの行をマージするにはどうすればよいですか？

ヘッダーとして存在する共通データに基づいて2つのファイルをマージしたい。

以下はその例です

ファイル1

>Feature scaffold1
1   100  g
101 200  g
201 300  g
>Feature scaffold2
1   100  g
01  500  g
>Feature scaffold3
10  500  g
>Feature scaffold4
10  300  g

ファイル2

>Feature scaffold1
500 500 r
900 1000    r
>Feature scaffold2
200 300 r
>Feature scaffold3
100 200 r
>Feature scaffold4
500 600 r
>Feature scaffold5
1   1000    r

そして、これが私が欲しい種類の出力です：

>Feature scaffold1
1   100 g
101 200 g
201 300 g
500 500 r
900 1000    r
>Feature scaffold2
1   100 g
01  500 g
200 300 r
>Feature scaffold3
10  500 g
100 200 r
>Feature scaffold4
10  300 g
500 600 r
>Feature scaffold5
1   1000    r

私はいくつかのawkとsedを試しましたが、明らかに成功していません。どうすればこれを行うことができますか？

Awk 解決：

awk '/^>/{ k=$1 FS $2 }
     NR==FNR{ 
         if (!/^>/) a[k]=(a[k]!="")? a[k] ORS $0: $0; next
     }
     k in a{ 
         print $0 ORS a[k]; delete a[k]; next 
     }1' file1 file2

• /^>/{ k=$1 FS $2 }- ヘッダー行に遭遇したとき（つまり>Feature ...）-1 k番目$1と2番目の$2フィールドからキーを作成します
• NR==FNR{ ... }-最初の入力ファイルを処理しています（file1）：
  • if (!/^>/) a[k]=(a[k]!="")? a[k] ORS $0: $0- 現在のキーを使用して非ヘッダー行を配列に蓄積しaますk
  • next -次のレコードにジャンプ
• k in a- file2レコードに基づく現在のキーが配列にある場合a（file1レコードに基づく）：
  • print $0 ORS a[k] -関連レコードを印刷する
  • delete a[k] -処理されたアイテムを削除します

出力：

>Feature scaffold1
1   100  g
101 200  g
201 300  g
500 500 r
900 1000    r
>Feature scaffold2
1   100  g
01  500  g
200 300 r
>Feature scaffold3
10  500  g
100 200 r
>Feature scaffold4
10  300  g
500 600 r
>Feature scaffold5
1   1000    r

別のアプローチとそれをより簡単にすること。

grep -v '^scaffold' <(awk -v RS='>Feature ' \
    'NF{s[$1]=s[$1]$0} END{for (x in s)print RS""s[x]}' file[12])