前のコマンドが終了するまでbashスクリプトを一時停止する

次のようなbashスクリプトがあります。

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

最初のループの後に別のforループを作成して、さらに30を継続したいと思います。たとえば、

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

新しいセットを開始する前に、ジョブの最初のセットが終了するようにします。しかしnohup、それらはすべて同時に実行されるようです。

私が持っているnohup、私はリモートで自分のサーバーにログインし、私はbash近いそこジョブを開始しているため。代替ソリューションはありますか？

waitコマンドを使用して、これを行うことができます。すべての子プロセスIDをキャプチャして、具体的にそれらを待つか、スクリプトが作成している唯一のバックグラウンドプロセスである場合wait、引数なしで呼び出すことができます。例えば：

#!/bin/bash
# run two processes in the background and wait for them to finish

nohup sleep 3 &
nohup sleep 10 &

echo "This will wait until both are done"
date
wait
date
echo "Done"

いくつかのポイント：

• nohupリモートシェル出口がワーカープロセスを強制終了しないようにすることが目標である場合はnohup、スクリプトが作成する個々のワーカープロセスではなく、スクリプト自体で使用する必要があります。

• ここで説明したように、nohupプロセスがSIGHUPを受信して​​端末と対話するのを防ぐだけですが、シェルとその子プロセスの間の関係を壊しません。

• 上記の点のため、の有無にかかわらずnohup、wait2つのforループの間の単純なループはfor、最初のループによって開始されたすべての子プロセスが終了した後にのみ実行されforます。

• シンプルなwait：

  現在アクティブなすべての子プロセスが待機され、戻りステータスはゼロです。

• 1番目にforエラーがなかった場合にのみ2番目を実行する必要がある場合は、各ワーカーPIDを$!で保存し、それらをすべてに渡す必要がありますwait。

  pids=
  for ...
      worker ... &
      pids+=" $!"
  done
  wait $pids || { echo "there were errors" >&2; exit 1; }
  

fg組み込みを使用します。バックグラウンドプロセスが完了するまで待機します。

help fg詳細をお試しください。

2つのforループの間に次のコードセグメントのようなものを挿入すると、役立つ場合があります。

flag=0

while [ flag -eq 0 ]
do
  ps -ef | grep "Rscript --vanilla" | grep -v grep > /dev/null
  flag=${?}
  sleep 10
done

もちろん、アプリケーションRscriptが正常に完了せずに残っ​​ている可能性がある場合は、2番目のforループを実行する機会がない可能性があります。上記のコードセグメントは、識別子Rscript --vanillaを持つすべてのプロセスが完了し、適切に消えることを想定しています。アプリケーションの動作と実行方法がわからないので、この前提に頼らなければなりません。

編集

コメントに照らして、これはあなたのニーズにより適しているでしょう。（元のコードと完了チェックロジックが含まれています）

for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
pids[$i]=${!}
done

flag=0

while [ flag -eq 0 ] 
do
  for PID in $(echo ${pids[@]})
  do
    flag=1
    ps -ef | grep ${PID} | grep -v grep >/dev/null; r=${?}
    if [ ${r} -eq 0 ]
    then 
      flag=0
    fi
  done
done

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done