wgetを使用したファイルのダウンロード

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このWebサイトからファイルをダウンロードしようとしています。

URL：http : //www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file

このコマンドを使用する場合：

wget http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file

index.html?acc=GSE48191ある種のバイナリ形式のみを取得します。

このHTTPサイトからファイルをダウンロードするにはどうすればよいですか？

wget

— user3138373
ソース

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あなた?はシェルによって解釈されると思います（vinc17による修正：おそらく、&解釈されるのはそれです）。

URLを単純な引用符で試してください：

wget 'http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file'

要求している.tarファイルはファイルですが、上記のコマンドはそれをとして保存することに注意してくださいindex.html?acc=GSE48191&format=file。正しく名前を付けるには、名前を.tar次のいずれかに変更できます。

mv 'index.html?acc=GSE48191&format=file' GSE4819.tar

または、次のオプションとして名前を指定できますwget。

wget -O GSE48191.tar 'http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file'

上記のコマンドは、ダウンロードしたファイルをGSE48191.tar直接保存します。

— ケオル
ソース

ダウンロードされますが、ディレクトリではありません。ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48191のリンクを見ると、複数の.gzファイルがあることがわかります。私はまだそれらにアクセスできませんか??

— user3138373 14

OPは、?一致するものがないため、ワイルドカードとして無視するシェルを使用すると思われます。主な問題は&次のとおりです。これにより、バックグラウンドで（したがって不完全なURLが）先行する部分が実行されます。しかし、解決策は同じです。URLを引用することです。

— vinc17 14

編集/修正については、terdonとvincに感謝します。@ user3138373：提供されたリンクに.gzファイルが見つかりません。参照/アクセスに使用するURLをもう一度教えてください。

— Qeole 14

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@ user3138373ダウンロードするファイル.tarは、.gzファイルを含むアーカイブ（ファイル）です。ダウンロードしたら、実行tar xvf GSE4819.tarしてアーカイブを展開し、ファイルにアクセスします。

— テルドン

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動作する可能性がある別の方法は、次のコマンドを使用することです。

wget -O nameOfTar.tar "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file"

この-Oコマンドは、ダウンロードする名前を指定します。

もちろん、最初の問題は、「＆」がシェルによって解釈されていたためです。URLを二重引用符で囲むと問題が修正されます。

— リエカヨ
ソース

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-O オプションは、ダウンロードされたデータが保存されるファイルの名前を指定するために使用されます。ダウンロードしたデータには影響がありません（おそらくそれがあなたの意図したことかもしれませんが、私はそれが不明瞭だと感じました）。

— Qeole 14

申し訳ありませんはい、私は私の補正を行います

— ryekayo

これがなぜ投票されたのかはわかりません。

— ryekayo

3

私はダウン投票しませんでしたが、それはおそらくあなたの解決策が問題を解決しないためです：&シェルによって解釈され、.tarファイルのダウンロードは失敗します。

— Qeole 14

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wget -O "name-you-want-to-save-as.format" http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191&format=file

これにより、現在のディレクトリにダウンロードするファイルが取得されます。

— サマン・ビクラム・ターパ
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wget: missing URLwgetに対する引数が欠落しているため、これに応答するものです-O。また、とにかくこれはOPの問題を解決しないと思います。

— セラダ

URLにはが含まれているため&、この回答は、URL を追加する""か''、URLの周りに配置しない限り機能しません。

— アーロンフランケ

0

$ curl -Gからhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191

<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//IETF//DTD HTML 2.0//EN">
<html><head>
<title>301 Moved Permanently</title>
</head><body>
<h1>Moved Permanently</h1>
<p>The document has moved <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191">here</a>.</p>
</body></html>

だからあなたはする必要があります

wget https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/download/?acc=GSE48191

httpの後の「s」に注意してください。私は自分で試してみましたが、うまくいきました。

— 手紙M
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