ユニゾン
UnisonはGUIとターミナルベースのツールであり、異なるローカルディレクトリとドライブ間、または異なるオペレーティングシステム上にあるネットワーク上で、ファイルとディレクトリを相互に同期させることができます。このアプリケーションは、Unixオペレーティングシステム(LinuxおよびMac OS X)およびWindowsで使用できます。さまざまな場所で変更を行うことができ、Unisonはファイルとフォルダーの正しいバージョンでマシンを更新し、必要に応じてファイルとディレクトリをコピー、削除、名前変更、または削除します。
Unison同期アプリは、おそらくUbuntu / Debianコミュニティで最も使用され、信頼されています。ソフトウェアセンターおよびパッケージマネージャーで入手できます。コマンドラインとグラフィックユーザーインターフェイス(GUI)(GTK)があります。
Unisonホームページ
UbuntuヘルプコミュニティWiki-Unison
Ubuntuマニュアル-Unison
リクエストに近い短い使用例は、Rmanoの回答にあります(下のスクリーンショット)。

FreeFileSync
FreeFileSyncは、ファイルの同期とフォルダーの同期に役立つ無料のデータバックアップソフトウェアです。データのバックアップの設定と実行にかかる時間を節約すると同時に、視覚的なフィードバックを提供するように設計されています。FreeFileSyncは、Windows、Linux、およびmacOSで利用可能なオープンソースソフトウェアです。
試したことはありませんが、一見の価値があるようです。デフォルトのGUIがあり、現在開発中です。
FreeFileSyncホームページ

シンクロン
Synkronは、ファイルとフォルダーを常に最新の状態に保つのに役立つアプリケーションです。ドキュメント、音楽、画像を簡単に同期して、どこにでも最新バージョンを保存できます。Synkronは使いやすいインターフェースを提供し、多くの機能を備えています。さらに、無料のオープンソースのクロスプラットフォームです。
Synkronホームページ

Directory A
適用されるとDirectory B
、ファイルが変更されるDirectory B
か、新しいファイルが作成されます。ただし、Directory A
2つのディレクトリはすでに同一であるため、この変更を適用できませんでした。ファイルを変更せずに変更することはできません。