回答:
私は物理学の学生であり、Ubuntuで最高の科学プロットソフトウェアはQtiPlotであることがわかりました。Originと非常によく似ており、非常にうまく機能します。
NumpyとMatplotlibは、データの処理と表示に適した組み合わせです。
利用可能な最高のデータ視覚化プログラムの1つです。それは、「美しい証拠」と「量的情報の視覚的表示」として、グラフィックデザインと科学コミュニケーションの古典の著者であるエドワードタフテのアイデアを実装しています。
Deducer GUIを使用すると、ggplot2が実装されているRプログラミング言語の知識を必要とせずにggplot2を使用できます。Excelを使用できる場合は、Deducerを使用できます。統計分析が有効になり、グラフ（ggplot2のおかげ）は効果的できれいになります。
#dependencies
sudo apt-get install r-core
sudo apt-get install rJava default-jdk
sudo R CMD javareconf
sudo R
#to install deducer
install.packages('JGR')
install.packages('Deducer')
library(JGR)
JGR()
#in JGR
library(Deducer)
gnuplotとxmgr / graceは、おそらく最も古いUnix科学グラフ作成プログラムです。私はまだgnuplotを時々使用しています（BTWはGNU ではなく、一部の人は無料ではないと考えています）、私はそれを知っており、長年使ってきましたが、今世紀にはあまり変わっておらず、今日の標準に従ってユーザーフレンドリー。
現在、最も有望なプログラムはQtiPlot、LabPlot、Veuszです。最初の2つは、Origin（Windowsで最も人気のあるプロットソフトウェア）に似ています。QtiPlotにはフルタイムの開発者がおり、より積極的に開発されているようです。VeuszはOriginクローンとは異なり、他のプログラムとは異なりPythonで作成されています。まだディストリビューションにはありませんが、PPAがあります。
データのプロットに使用する別のプログラムは、fitykです。それは曲線近似に特化しており、私はそれをよく知っているので（私はそれを書いた）主にプロットに使用しますが、ほとんどの場合、QtiPlotまたはVeuszが最良の選択になると思います。
DataSceneをお勧めします。それは本当にクールなグラフとチャートアニメーションを生成します。ウィザードとチュートリアルのおかげで、学習曲線は非常に平坦です。DataSceneの詳細については、次を参照してください。
Veuszは、私がこれまでに見つけた最高のオープンソースプロットツールです。マイナーおよびメジャーティックサイズなど、科学プロットの非常に詳細な属性を設定できます。また、データセットを操作する操作も提供します。SVGエクスポートをサポートし、他のプログラムからリモートで制御できます。さらに、サポートに関する私の経験は非常に優れています。著者は1日以内に私の質問に答え、2週間以内に機能リクエストを実装しました。
Rは、統計的検定とグラフの両方に最適です。プログラミングに問題がない場合は、Rを選択してください。オープンソースで強力です。
または、プログラミングに時間がかかりすぎる場合は、BioVinciを試してください。データをドラッグアンドドロップして統計を実行し、プロットを作成できます。バイオリンプロットやインタラクティブな3D散布図（ホバリング情報付き）など、最新のプロットタイプが気に入っています。さらに、PCAがあります-科学研究に非常に役立ちます。さらに、Ubuntu 16.04、18.04、Debian 9をサポートしています。
お役に立てれば！ PCA 3Dプロットのスクリーンショットを次に示します。