回答:
アプリの新しいChromiumプロファイルを作成すると、問題が回避されます(これは11.04に固有です。11.10は、Unityレベルでこの問題を修正します)。
Webサイトをアプリウィンドウとして開くには
--app=http://example.org
、クロムのランチャーパラメーターに追加します。新しいプロファイルの作成と使用は、追加するのと同じくらい簡単です--user-data-dir=/path/to/profile
各Webアプリケーションに異なるパスを設定する限り、それらは別々のアプリケーションとして扱われます。