Ubuntu 14.04を実行しています。通常、ユニティランチャーは自動非表示モードになっています。デスクトップがロックされてからロック解除されると、問題が始まります。その後、ユニティランチャーは再び消えません。
Alt+Ctrl+F3、ユーザー名とパスワードを使ってログイン&これを試してdconf reset -f /org/compiz/、その後setsid unity、その後sudo reboot
Super+Lが、ロックして使用している場合は発生しませんAlt+Ctrl+L。

setsid unity&autohide!