回答:
aptの更新はと呼ばれるスクリプトによってトリガーされ/etc/cron.daily/aptます。/etc/cron.daily毎日発生するいくつかのスクリプトが含まれていますが、すべて同時に実行されます。Update Managerが更新される時刻を変更するには、すべての/etc/cron.dailyスクリプトが起動する時刻を変更する必要があります。
そのためには、/etc/crontabファイルを編集する必要があります。
sudoedit /etc/crontab # or: gksu gedit /etc/crontab
これはかなり標準的なcronファイルで、次のようになります。
# /etc/crontab: system-wide crontab
# Unlike any other crontab you don't have to run the `crontab'
# command to install the new version when you edit this file
# and files in /etc/cron.d. These files also have username fields,
# that none of the other crontabs do.
SHELL=/bin/sh
PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin
# m h dom mon dow user command
17 * * * * root cd / && run-parts --report /etc/cron.hourly
25 6 * * * root test -x /usr/sbin/anacron || ( cd / && run-parts --report /etc/cron.daily )
47 6 * * 7 root test -x /usr/sbin/anacron || ( cd / && run-parts --report /etc/cron.weekly )
52 6 1 * * root test -x /usr/sbin/anacron || ( cd / && run-parts --report /etc/cron.monthly )
#
これから、cron.daily午前6時25分にトリガーを確認できます。午前4時に開始する場合は、2回目の行を次のように置き換えます。
0 4 * * * root test -x /usr/sbin/anacron || ( cd / && run-parts --report /etc/cron.daily )
この形式についてさらにサポートが必要な場合は、Wikipedia にCronに関する異常な技術ページがあります。
人々に感謝します。アンバーは、locoチームのIRCチャンネルで私が尋ねた質問から私に代わってこれを尋ねました。私はそれがcronの仕事であると考え、自分でこれを理解しようとしてそれら（/etc/cron.*）を掘り下げていました。そのため、朝のニュースビデオを見ているときにCPU使用率が急上昇することはありません。
時間のシフトがあるようです。夏時間によるものと思われます。今朝からの抜粋です。
Apr 21 07:30:01 flounder CRON[21032]: (root) CMD (start -q anacron || :)
Apr 21 07:30:01 flounder anacron[21035]: Anacron 2.3 started on 2011-04-21
Apr 21 07:30:01 flounder anacron[21035]: Will run job `cron.daily' in 5 min.
Apr 21 07:30:01 flounder anacron[21035]: Will run job `cron.weekly' in 10 min.
Apr 21 07:30:01 flounder anacron[21035]: Jobs will be executed sequentially
Apr 21 07:35:01 flounder anacron[21035]: Job `cron.daily' started
これを解決済みとしてマークします。
APT::Periodic::RandomSleepAPT構成設定で最大スリープ時間を変更できます。最大値0は常にすぐに発生することを意味します（ただし、ランダムスリープが存在する理由を覚えておいてください！）。