回答:
Ubuntu 12.04はUbuntuの長期サポートバージョンであり、5年間のメンテナンスおよびセキュリティアップデートでサポートされています。Ubuntuは、Unityをデスクトップユーザーインターフェイスとして使用し、ユーザーエクスペリエンスを大幅に変更したりシステムを壊したりすることはなく、ほとんどバグ修正である更新プログラムでスケジュールどおりにサポートされます。
一方、Gnome 3.6（あなたはGnome Shellと呼んでいます）はGnomeコミュニティによって管理されており、最新の状態を保つ唯一の方法は外部の非公式リポジトリを使用することです。gnomeで利用可能なPPAは最終的に3.6をバックポートしますが、あなたが何をしているのかわからない場合はシステムが壊れる可能性があります。
Gnomeライブラリには、12.04との完全な互換性がない多くの変更があり、準備ができたら12.10にアップグレードすることをお勧めします。このバージョンでは、GTK3ライブラリをアップストリームのGnome 3と同期し、Gnome 3.6がより快適になります。
また、Ubuntu 12.10 Gnome Remix（Gnomubuntu）があり、UnityではなくGnome Shell 3.xを必要とする人々のニーズを満たすように設計されています。