回答:
これらのGUIの変更が保存されるファイルは(FF 33以降)localstore.rdfのようです。手で修正しても、私にとって望ましい効果はありませんでした。
ただし、GUIを変更すると、新しい設定エントリbrowser.uiCustomization.stateが作成されることがわかりました。これはjson文字列であり、さまざまな場所とその中のアイテムを記述しています。そのエントリを変更することにより、ウィジェットの位置を永続的に変更できます。
about:configメニューにアクセスできない状況にいる場合はpref.js、プロファイルディレクトリ(~/.mozilla/firefox/yourprofile/linux)のファイルでそのエントリを設定および変更できます。
私の推測では、この文字列はxulstore.jsonFF34 [1]で始まるファイルに保存されますが、そのバージョンにはアクセスできないため、他の誰かが確認する必要があります。