回答:
ImageMagick 6.9.9.19からmogrifyが入力ファイルと同じディレクトリに結果を書き込むので、次のコマンドを使用できます。
find . -name '*.NEF' -exec mogrify -format jpg {} +
説明:
-name '*.NEF'
すべての* .NEFファイルを検索します。-iname
検索で大文字と小文字を区別しない場合に使用します。
-exec ... {} +
一致するすべてのファイルに対してコマンドを実行します。別の方法として、findとxargsを組み合わせる方法があります。