私はLinux Mint 13を3台のモニタで動かしています。グラフィックスカードはnVidia Quadro NVS 450です。2台のモニターはTwinViewとして結合されています。もう1台は「別のXディスプレイ」です。すべてうまく表示されています。
TwinViewペアではMATEウィンドウマネージャが実行されていますが、 "Separate X"セッションでは従来のGnome 2ウィンドウマネージャが使用されているようです。 nvidia-settingsを使用してディスプレイを設定するときに行ったことは、モニタの配置を指定することだけでしたが、ウィンドウマネージャを指定することはできませんでした。
私はMATEをその別のXディスプレイに入れたいのですが、それがこのWM構成にどのようになったのか、またどのように変更するのか私は知りません。