UbuntuでのRODBCインストールの問題

LinuxでRにRODBCをインストールしようとすると、ヘッダーが欠落しているという問題があります。誰でもこの問題で私を助けることができますか？

> install.packages("RODBC")

Installing package(s) into ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12’
(as ‘lib’ is unspecified)

trying URL 'http://cran.cnr.Berkeley.edu/src/contrib/RODBC_1.3-2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1108358 bytes (1.1 Mb)

opened URL
==================================================
downloaded 1.1 Mb

* installing *source* package ‘RODBC’ ...
checking for gcc... gcc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables... 
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc accepts -g... yes
checking for gcc option to accept ANSI C... none needed
checking how to run the C preprocessor... gcc -E
checking for egrep... grep -E
checking for ANSI C header files... yes
checking for sys/types.h... yes
checking for sys/stat.h... yes
checking for stdlib.h... yes
checking for string.h... yes
checking for memory.h... yes
checking for strings.h... yes
checking for inttypes.h... yes
checking for stdint.h... yes
checking for unistd.h... yes
checking sql.h usability... no
checking sql.h presence... no
checking for sql.h... no
checking sqlext.h usability... no
checking sqlext.h presence... no
checking for sqlext.h... no
configure: error: "ODBC headers sql.h and sqlext.h not found"
ERROR: configuration failed for package ‘RODBC’
* removing ‘/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/RODBC’
Warning in install.packages :
  installation of package 'RODBC' had non-zero exit status

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpqfNYpD/downloaded_packages’

Dirkがコメントで述べたように、r-cran-rodbcを既にインストールしている場合、R内からinstall.packages（）を実行する必要はありません。「library（RODBC）」はパッケージをロードする必要があります。

より一般的には、ヘッダーに関するエラーが表示される場合、必要な開発ライブラリがインストールされていないためです。解決策は、不足しているヘッダーファイルの名前（たとえば、「sqlext.h ubuntu」のGoogle）を使用してWebを検索し、必要なパッケージを識別することです。この場合、libiodbc2-devが必要です。そう：

sudo apt-get install libiodbc2-dev

その後、R内のインストールが機能するはずです。

本当にソースからビルドする必要がありますか？バイナリパッケージを使用しないのはなぜですか？

だから代わりにこれを試してみてください：

  sudo apt-get install r-cran-rodbc

または、パッケージ管理システムのGUIフロントエンドのいずれかを使用します。

このサイトやその他のサイトのすべてのソリューションからパッケージをインストールしようとした後、私は以下RODBCを使用してパッケージを構築することに成功しました。

sudo apt-get install unixodbc unixodbc-dev

私もインストールしました：

• libiodbc2-dev
• libmyodbc
• odbc-postgresql

FWIW、OS Xで同じ問題（「ODBCヘッダーsql.hおよびsqlext.hが見つかりません」）があり、unixodbc（brew install unixodbc）をインストールすることで修正しました

RODBCはRに依存しています（> = 3.0.0（たとえばhttps://cran.r-project.org/web/packages/RODBC/RODBC.pdfを参照）

ローカルパッケージライブラリ...

Installing package(s) into '/home/administrator/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12'

... Rの古いバージョン（2.12）がインストールされている可能性があります。この場合は、Rの最新バージョンにアップグレードしてください。

私もこの問題を抱えていました。私にとっての解決策は、次のようなUbuntuの依存関係が欠落していたことでした

• unixodbc（> = 2.2.11）
• libmyodbc
• odbc-postgresql

これらのパッケージをピックアップinstall.packages("RODBC", dependencies=TRUE)しないことは注目に値します。彼らはRそれ自体の外側にあります。