回答:
電子メールメッセージを選択すると、下でEdit -> Unread Marks -> Mark Selected Read
実行されます。
更新
@Leonsからコメントを取得
Notes 8.5では、次の動作をデフォルトにすることができます。
File > Preferences > Basic Notes Client Config
Additional Options
リストボックス内のボックスをチェックします:
[x] Mark documents read when opened in preview pane