この質問は以前に聞かれたことを理解していますが、他の質問や回答を受けている人たちとは別のバージョンのSkypeを使用していると思います。
グループ会話の新しいメッセージアラートをミュートしますが、開いている残りのチャットのアラートは維持します。私の検索で2つのソリューションが見つかりました。
1-チャットコマンド
これは私のために働いていません。コマンドの前にスペースはありませんが、テキストとしてのみ表示されます。これは、おそらくこの機能を無効にするための設定がSkype内にあると信じさせてくれます。そうでない場合、この機能は通常のSkype内にあるため、Skype for Business内では提供されない可能性があります。
2-この特定のウィンドウのサウンドオプションを調整する
私のサウンドオプションは、他のほとんどのオプションと一緒にロックされているため、これは利用できません。ワークステーションに対する権限は非常に限られています。
現在使用しているバージョンは、Windows 10 Enterprise上のSkype for Business 2016 MSO（16.0.8431.2046）です。