回答:
WiXツールセット(http://wixtoolset.org)を使用してインストーラーパッケージを作成できます。多少の作業が必要ですが、GPOを介して展開できる有効なMSIファイルを生成し、無料/オープンソースです。
なぜこの質問が重く投票されるのか分かりません、関連があるようです。
このようなEXEファイルの企業展開で通常行われるのは、「アプリケーションリパッケージャーツール」(ツールのリストについてはリンクを参照)を使用して、EXEファイルによる変更をキャプチャし、Windowsインストーラーファイルを生成することです。MSIファイルと呼ばれるこのファイルは、サイレントインストールとリモート管理を完全にサポートする企業シナリオに展開できます。
重要な課題は、MSIファイルにジャンクを入れないように、キャプチャしたものをクリーンアップすることです。これはそれ自体の職業です-それを行う人々は「アプリケーションパッケージャー」と呼ばれます-そして、それは正しく行うために多くの経験を必要とする仕事です。
パッケージ化する複数のEXEファイルがある場合は、専門の展開スペシャリストまたはアプリケーションパッケージャーに連絡して、このソフトウェアを適切に展開してもらうことをお勧めします。私は経験豊富なシステム管理者を知っていて、アプリケーションのパッケージングを扱うのが難しいと感じています。