タグ付けされた質問 「kaplan-meier」

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Bayesian Survival Analysis:カプラン・マイヤーの事前記事を書いてください!
時刻イベントを使用した、右打ち切りの観測を検討します。時間の影響を受けやすい個人の数はであり、時間のイベントの数はです。i n i i d it1,t2,…t1,t2,…t_1, t_2, \dotsiiininin_iiiididid_i 生存関数がステップ関数場合、Kaplan-Meierまたは積推定量は自然にMLEとして発生します。尤度は あり、MLEはです。 L (α )= Π I(1 - α I )D I α N I - D I I α I = 1 - D IS(t)=∏i:ti&lt;tαiS(t)=∏i:ti&lt;tαiS(t) = \prod_{i : t_i < t} \alpha_iL(α)=∏i(1−αi)diαni−diiL(α)=∏i(1−αi)diαini−di L(\alpha) = \prod_i (1-\alpha_i)^{d_i} \alpha_i^{n_i-d_i} αˆ私= 1 − d私n私α^i=1−dini\widehat\alpha_i …

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離散時間生存分析に関する基本的な質問
ロジスティック回帰モデルを使用して離散時間生存分析を実行しようとしていますが、プロセスを完全に理解しているかどうかはわかりません。いくつかの基本的な質問に対する支援をいただければ幸いです。 設定は次のとおりです。 5年間の期間内にグループのメンバーシップを見ています。各メンバーには、メンバーがグループに属する月ごとにメンバーシップの月間記録があります。5年の期間中にメンバーシップを開始したすべてのメンバーを検討しています(以前に参加したメンバーとの「左検閲」問題を回避するため)。各レコードは時間によってインデックス付けされ、時間1はメンバーが参加した月です。したがって、2年半滞在しているメンバーには、1から30までの30の月間レコードがあります。各レコードには、メンバーシップの最後の月の値が1、それ以外の場合はゼロのバイナリ変数も与えられます。バイナリ変数の値1は、メンバーがグループを脱退したイベントをマークします。メンバーシップが5年間の分析期間を超えて継続する各メンバーについて、 したがって、ロジスティック回帰モデルは、バイナリイベント変数の値を予測するために構築されます。ここまでは順調ですね。バイナリ予測モデルを評価する一般的な方法の1つは、ホールドアウトサンプルのリフトを測定することです。メンバーシップ終了イベントを予測するために構築したロジスティック回帰モデルでは、イベントに対する非イベントの比率を5対1にしたホールドアウトデータセットのリフトを計算しました。予測値を十位にランク付けしました。最も高い予測値を持つ十分位数には70%が含まれ、4を超えるリフトがあります。結合された最初の2つのdecilesには、ホールドアウトのすべての60%が含まれます。特定の状況では、これはかなり適切な予測モデルと見なされますが、生存分析を実行するのに十分かどうかは疑問です。 してみましょう、個々のハザード関数であるヶ月で、とlet、個々の確率もヶ月を通じて存続。h[j,k]h[j,k]h[j,k]jjjkkkS[j,k]S[j,k]S[j,k]jjjkkk 基本的な質問は次のとおりです。 離散ハザード関数は、各月の非生存(グループを離れる)の条件付き確率ですか?h[j,k]h[j,k]h[j,k] ハザード関数のロジスティック回帰モデル推定からの予測値はありますか?(つまり、は月個々のモデル予測値に等しいか、ハザード関数の推定値を取得するためにさらに何かする必要がありますか?)h[j,k]h[j,k]h[j,k]jjjkkk 個々の月qまでの生存確率は、1からまでのハザード関数を1から引いた積に等しい、つまり ?jjjqqqS[j,q]=(1−h[j,1])⋅(1−h[j,2])⋅…⋅(1−h[j,q])S[j,q]=(1−h[j,1])⋅(1−h[j,2])⋅…⋅(1−h[j,q])S[j,q] = (1 - h[j,1]) \cdot (1 - h[j,2]) \cdot \ldots \cdot (1 - h[j,q]) 各時間すべての個体わたるの平均値は、母集団全体の平均生存確率の合理的な推定値ですか?S[j,k]S[j,k]S[j,k]jjjkkk 人口全体のプロットは、月ごとの生存確率を月ごとのカプラン・マイヤーグラフに似せるべきですか? これらの質問のいずれかに対する答えが「いいえ」の場合、深刻な誤解があり、実際に何らかの支援/説明を使用できます。また、正確な生存プロファイルを作成するために、バイナリ予測モデルがどれほど優れている必要があるかについての経験則はありますか?

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Rでの生存確率の推定
生存時間のサンプルに基づいて、カプラン・マイヤー推定器を使用して、特定のtについて、生存時間tの確率を推定したいと思います。でこれを行うことは可能ですか?tは必ずしもイベント時間ではないことに注意してください。nnnttttttRttt
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機械学習モデル(GBM、NNなど)を生存分析に使用するにはどうすればよいですか?
Cox Proportional Hazards回帰やいくつかのKaplan-Meierモデルなどの従来の統計モデルを使用して、障害などのイベントの次の発生までの日数を予測できることを知っています。つまり、生存分析 ご質問 GBMやニューラルネットワークなどの機械学習モデルの回帰バージョンを使用して、イベントが発生するまでの日数を予測するにはどうすればよいですか? 発生までの日数をターゲット変数として使用し、単に回帰モデルを実行するだけでは機能しないと思いますか?なぜ機能しないのか、どうすれば修正できますか? 生存分析問題を分類に変換してから、生存確率を取得できますか?その後、バイナリターゲット変数を作成する方法は? 機械学習アプローチとコックス比例ハザード回帰およびカプラン・マイヤーモデルなどの長所と短所は何ですか? サンプル入力データが以下の形式であることを想像してください 注意: センサーは10分間隔でデータをpingしますが、NAの行で表されるように、ネットワークの問題などによりデータが欠落する場合があります。 var1、var2、var3は予測変数、説明変数です。 failure_flagは、マシンが失敗したかどうかを示します。 マシンIDごとに10分間隔で6か月分のデータがあります 編集: 予想される出力予測は以下の形式である必要があります 注:毎日のレベルで、今後30日間の各マシンの障害の可能性を予測します。

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カプラン・マイヤー曲線はコックス回帰とは別の言い方をしているようです
Rでは、がん患者の生存データ分析を行っています。 CrossValidatedやその他の場所での生存分析について非常に役立つ情報を読んでおり、Cox回帰の結果を解釈する方法を理解したと思います。しかし、1つの結果はまだ私を悩ませます... 生存率と性別を比較しています。カプラン・マイヤー曲線は明らかに女性患者に好意的です(私が追加した凡例が正しいことを何度か確認しました。最大生存期間4856日の患者は実際に女性です): そして、コックス回帰が戻ってきています: Call: coxph(formula = survival ~ gender, data = Clinical) n= 348, number of events= 154 coef exp(coef) se(coef) z Pr(&gt;|z|) gendermale -0.3707 0.6903 0.1758 -2.109 0.035 * --- Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 exp(coef) exp(-coef) lower .95 …
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