線形混合効果モデルの結果を示すプロット

私はRで線形混合効果モデリングを使用していくつかのデータを分析しています。私は結果をポスターに含めることを計画しています。モデル。残差プロット、フィット値と元の値のプロットなどについて考えていました。

これは私のデータに大きく依存することはわかっていますが、線形混合効果モデルの結果を説明するための最良の方法を感じようとしていました。Rでnlmeパッケージを使用しています。

ありがとう

それはあなたのモデルに依存しますが、私の経験では、混合効果モデルについて十分に理解していない同僚でさえ、異なるグループ化レベルで予測をプロットする場合と同様に、次のようになります。

library(nlme)
fm2 <- lme(distance ~ age + Sex, data = Orthodont, random = ~ 1|Subject)

newdat <- expand.grid(Sex=unique(Orthodont$Sex),
                  age=c(min(Orthodont$age),
                            max(Orthodont$age)))

library(ggplot2)
p <- ggplot(Orthodont, aes(x=age, y=distance, colour=Sex)) +
  geom_point(size=3) +
  geom_line(aes(y=predict(fm2), group=Subject, size="Subjects")) +
  geom_line(data=newdat, aes(y=predict(fm2, level=0, newdata=newdat), size="Population")) +
  scale_size_manual(name="Predictions", values=c("Subjects"=0.5, "Population"=3)) +
  theme_bw(base_size=22) 
print(p)