線形混合効果モデルの結果の報告


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線形混合効果モデルは、生物学の隅では一般的に使用されていません。執筆しようとしている論文で使用した統計検定を報告する必要があります。生物科学のいくつかの分野でマルチレベルモデリングの認識が現れ始めていることを知っています(依存関係の解決策:ネストされたデータに対応するためにマルチレベル分析を使用)。

私の実験デザインの概要:
*被験者は4つの治療グループの1つに割り当てられました
*従属変数の測定は治療開始後のさまざまな日に行われました
*デザインは不均衡です一部の被験者の数日間の測定値)
*治療Aは参照カテゴリーです*治療
の最終日にデータを集中しました

治療A(参照カテゴリー)が他の治療(治療終了時)よりも有意に良い結果をもたらすかどうか知りたいです。

私はnlmeを使用してRで分析を行いました:

mymodel <- lme(dv ~ Treatment*Day, random = ~1|Subject, data = mydf, na.action = na.omit, 
+ correlation = corAR1(form = ~1 |Subject), method = "REML")

また、出力(一部、簡潔にするために切り捨てられます)は次のとおりです。

>anova(mymodel)
              numDF denDF  F-value p-value
(Intercept)      1   222 36173.09  <.0001
Treat            3    35    16.61  <.0001
Day              7   222     3.43  0.0016
Treat:Day       21   222     3.62  <.0001

>summary(mymodel)
Fixed effects: dv ~ Treatment * Day 
                       Value Std.Error  DF  t-value p-value
(Intercept)         7.038028 0.1245901 222 56.48945  0.0000
TreatmentB          0.440560 0.1608452  35  2.73903  0.0096
TreatmentC          0.510214 0.1761970  35  2.89570  0.0065
TreatmentD          0.106202 0.1637436  35  0.64859  0.5208

したがって、治療の日によって効果が異なること、および治療の最終日(データが中央に配置される場所)では、治療Aと治療BまたはCでdvが有意に異なることがわかります。

私が言いたいのは、「予測どおり、治療A(平均+/- SE)を受けた被験者の方が治療B(平均+/- SE、p = 0.0096)または治療を受けた被験者よりも従属変数が有意に低いことがわかりました。 C(平均+/- SE、p = 0.0065)、治療の最終日に測定。」

しかし、どの統計検定が行われたかを示す必要があります。これは分析を説明するのに受け入れられる方法でしょうか?「[測定方法]は示された日に実行され、従属変数(単位)が決定されました。[治療の最終日]を中心とする線形混合効果モデルを使用して、対数変換データを分析しました。標準誤差。治療の最終日に、dvは治療B(平均+/- SE、p = 0.0096)よりも治療A(平均+/- SE)で有意に低かった... "

具体的には、
*これは使用した統計検定について十分なことを言っていますか?(読者は「平均+/- SE、p = 0.0096、スチューデントのt検定」のようなものを見るのに慣れていますが、「p = 0.0096、線形混合効果からの治療B対治療Aの係数」と書くのは奇妙に思えます[治療の最終日]のモデル。」)
*これを配置するより良い方法はありますか?

(メソッドセクションには、統計に関する詳細が含まれます。「[測定方法]データは、RおよびRパッケージを使用して分析されました...ランダム効果として被験者を使用して線形混合効果モデルを使用して、次数1の自己相関構造(AR1)固定効果として、処理と日、および処理と日の相互作用を含めました。混合効果の分析では、固定効果のモデルとランダム効果のみのヌルモデルを比較する尤度比テストを実行しました。」

多くの場合、統計を嫌う聴衆(および相対的な統計初心者によって書かれた)のための線形混合効果モデルの結果を報告する方法に関するアドバイスは大歓迎です!


調査の最終日に「中心」とはどういう意味かをもっと説明できますか?なぜ研究の最終日の日数を0として1日だけをポンプしないのですか?また、要約表では、相互作用の影響はどこにありますか?
コリン14年

回答:


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これはあなたの質問に答える助けにはならないかもしれませんが、実験で反復測定(日)があることに気付きましたが、これがモデルで反復測定であることを示していませんでした。私はあなたのモデルのランダムな用語はそのようなものだと思っていただろう:

mymodel <- lme(dv ~ Treatment*Day, random = ~1|Subject/Day, 
               data = mydf, na.action = na.omit,
               correlation = corAR1(form = ~1 |Subject/Day), method = "REML")

結果の報告に関しては、治療の間に大きな違いが見られる日に報告するつもりでしたか?もしそうなら、インタラクション用語の対比も見て/報告する必要があると思います。私は統計初心者ですが、基本的にあなたと同じ質問があります:-)

Andy Fieldの「Rを使用した統計の発見」では、Ch14で線形混合効果モデルの結果を報告する方法について説明しています。私は手元に本を持っていませんが、もう一度手に入れたらこの投稿を編集できます。


それは、日がすべてのサブジェクトで同じである場合、ネストされたランダムファクターではなく、交差したものだと思いますよね?それからrandom= Day|Sあなたはbject日は連続しているため、垂直線の前に配置されます。コメントありがとう!
オーラボレアリス
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