doSMPを使用したキャレットパッケージの並列化

更新：キャレットはforeach内部的に使用するようになったため、この質問はもはや関連性がありません。の動作する並列バックエンドを登録できる場合foreach、キャレットはそれを使用します。

私はR のキャレットパッケージを持っていて、train関数を使用してモデルを交差検証することに興味があります。ただし、速度を上げたいので、キャレットは並列処理をサポートしているようです。Windowsマシンでこの機能にアクセスする最良の方法は何ですか？doSMPパッケージを持っていますが、foreach関数を関数に変換する方法がわからないlapplyので、関数に渡すことができtrainます。

trainドキュメントから、私がやりたいことの例を以下に示します。これはまさに私がやりたいことですが、doSMPパッケージではなくパッケージを使用していdoMPIます。

## A function to emulate lapply in parallel
mpiCalcs <- function(X, FUN, ...)
}
    theDots <- list(...)
    parLapply(theDots$cl, X, FUN)
{

library(snow)
cl <- makeCluster(5, "MPI")

## 50 bootstrap models distributed across 5 workers
mpiControl <- trainControl(workers = 5,
    number = 50,
    computeFunction = mpiCalcs,
    computeArgs = list(cl = cl))

set.seed(1)
usingMPI <- train(medv ~ .,
    data = BostonHousing,
    "glmboost",
    trControl = mpiControl)

次に、lapplyのドキュメントと同じ変数名を使用するmbqの関数のバージョンを示します。

felapply <- function(X, FUN, ...) {
    foreach(i=X) %dopar% {
        FUN(i, ...)
    }       
}

x <- felapply(seq(1,10), sqrt)
y <- lapply(seq(1,10), sqrt)
all.equal(x,y)

やってみる

computeFunction=function(onWhat,what,...){foreach(i=onWhat) %do% what(i,...)},

キャレットは、train()関数の一部として既に内部でこれを実行しています。初心者向けのキャレットWebページの下部のセクションを参照してください。