Rでの箱ひげ図のラベル付け


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軸なしで箱ひげ図を作成して現在のプロット(ROC曲線)に追加する必要がありますが、箱ひげ図にさらにテキスト情報を追加する必要があります。最小と最大のラベルです。現在のコード行は次のとおりです(現在のグラフも)。

助力に感謝します。

boxplot(data, horizontal = TRUE, range = 0, axes=FALSE, col = "grey", add = TRUE)

他の解決策は、(x軸ではなく)0から1までの線を追加することですが、中心線を通るようにしたいです...たとえば、このグラフィックのように

ここに画像の説明を入力してください

回答:


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これはあなたが手描きの図のようなものを生み出すと思うでしょう。

data    <- c(0.4, 0.7, 0.75, 0.82, 0.9)
endaxis <- c(0, 1)  # endpoints of axis
datamm  <- c(min(data), max(data))
boxplot(data, horizontal = TRUE, range = 0, ylim = endaxis,
                    axes = FALSE, col = "grey", add = FALSE)
arrows(endaxis, 1,  datamm, 1,  code = 1, angle = 90, length = 0.1)
valuelabels <- c(endaxis[1], round(fivenum(data)[2], digits = 2) ,
                 round(fivenum(data)[4], digits = 2), endaxis[2]  ) 
text(x = valuelabels, y = c(1.05, 1.25, 1.25, 1.05), labels = valuelabels)

値ラベル付きのR箱ひげ図

それを行うにはおそらくもっと良い方法があるでしょう。ROCプロットに合わせて変更する必要がある場合があります。add = FALSE


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まあ、あなたの応答はOPによって尋ねられたものにもっと近いようです(だから私は+1しました)。しかし、私はこれが箱ひげ図ではなくなったように感じるか、少なくとも、可能性のある外れ値を見つけることに興味を失いました。特筆すべきは、箱ひげ図をもう少しカスタマイズすることです(pars縦横比(boxwex)とひげのサイズ()を減らすための引数を参照してくださいstaplewex)。
2009年

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スタンドアロンバージョンについては、次のようなものを試してください。

bxp <- boxplot(rnorm(100), horizontal=TRUE, axes=FALSE)
mtext(c("Min","Max"), side=3, at=bxp$stats[c(1,5)], line=-3)

を呼び出すとboxplot、いくつかの情報、特に「5つの番号」を取得できることに注意してください。

あなたはそれが別の図形に重畳する場合は、使用しadd=Tますが置き換えるmtextことでtext、値を設定する必要があります(他のグラフィックをプロットする方法によって異なります)。y

より完全な例がJohn Maindonaldによって提供されました(コードは彼のWebサイトにあるはずです):

ここに画像の説明を入力してください


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完全にカスタマイズ可能なggplot2ボックスプロット ...

#bootstrap
data <- data.frame(value=rnorm(100,mean = 0.5, sd = 0.2),group=0)
#processing
metaData <- ddply(data,~group,summarise,
            mean=mean(data$value),
			sd=sd(data$value),
            min=min(data$value),
			max=max(data$value),
            median=median(data$value),
			Q1=0,Q3=0
			)
bps <- boxplot.stats(data$value,coef=1.5) 
metaData$min <- bps$stats[1] #lower wisker
metaData$max <- bps$stats[5] #upper wisker
metaData$Q1 <- bps$stats[2] # 1st Quartile
metaData$Q3 <- bps$stats[4] # 3rd Quartile

#adding outliers
out <- data.frame() #initialising storage for outliers
if(length(bps$out) > 0){
	for(n in 1:length(bps$out)){
		pt <-data.frame(value=bps$out[n],group=0) 
		out<-rbind(out,pt) 
	}
}
#adding labels
labels <-data.frame(value=metaData$max, label="Upper bound")
labels <-rbind(labels,data.frame(value=metaData$min, label="Lower bound"))
labels <-rbind(labels,data.frame(value=metaData$median, label="Median"))
labels <-rbind(labels,data.frame(value=metaData$Q1, label="First quartile"))
labels <-rbind(labels,data.frame(value=metaData$Q3, label="Third quartile"))

#drawing
library(ggplot2)
p <- ggplot(metaData,aes(x=group,y=mean))
p <- p + geom_segment(aes(x=c(0.1,0,0.1),y=c(0,0,1),xend=c(0,0,-0.1),yend=c(0,1,1)))
p <- p + geom_text(aes(y=c(0,1),label=c(0,1),x=0.2))
p <- p + geom_errorbar(aes(ymin=min,ymax=max),linetype = 1,width = 0.5) #main range
p <- p + geom_linerange(aes(ymin=min,ymax=max),linetype = 1,width = 0, color="white")# white line range
p <- p + geom_linerange(aes(ymin=min,ymax=max),linetype = 2)    #main range dotted
p <- p + geom_crossbar(aes(y=median,,ymin=Q1,ymax=Q3),linetype = 1,fill='white') #box
if(length(out) >0) p <- p + geom_point(data=out,aes(x=group,y=value),shape=4) # drawning outliers if any
p <- p + scale_x_discrete(breaks=c(0))
p <- p + scale_y_continuous(name= "Value")
p <- p + geom_text(data=labels,aes(x=0.5,y=value,label=round(value,2)),colour="black",angle=0,hjust=0.5, vjust=0.5,size=3)

p <- p + opts(panel.background = theme_rect(fill = "white",colour = NA)) 
p <- p + opts(panel.grid.minor = theme_blank(), panel.grid.major = theme_blank())
p <- p + opts(axis.title.x=theme_blank())
p <- p + opts(axis.text.x = theme_blank())
p <- p + opts(axis.title.y=theme_blank())
p <- p + opts(axis.text.y = theme_blank())

p + coord_flip()

結果:

ここに画像の説明を入力してください

...コードは少し醜いかもしれませんが、正しく動作します。


2

これが私のソリューションの私の実装です。私は平均値をマッピングしないことに決めました、あまり多くのスペースが残っていません。また、0から1までの線は奇妙に見えます。みなさん、ありがとうございました。

data <- read.table("roc_average.txt")
bxp <- boxplot(data, horizontal = TRUE, range = 0, axes = FALSE, col = "grey", add = TRUE, at = 0.2, varwidth=FALSE, boxwex=0.3)
valuelabels <- c(round(fivenum(data)[2], digits = 2), round(fivenum(data)[4], digits = 2))
text(x = valuelabels, y = c(0.35, 0.35), labels = valuelabels, font = 2)
mtext(c(min(round(data, digits = 2)),max(round(data, digits = 2))), side=1, at=bxp$stats[c(1,5)], line=-3, font = 2)

ボックスプロットを使用したroc曲線


ボックスプロットはAUCを要約することになっていますか?もしそうなら、なぜ最小値は0.5ですか?
2009年

うん、いくつかのROCは0.5未満でなければならないので、奇妙に見えます。何が問題なのかを
調べる

これが、0.5未満の値のROC AUCを反転させたポイントなので、グラフィックを再作成する必要があります。どうもありがとう!
Vladimir Chupakhin、2011

+1戻ってきます。更新を待っています。さまざまな分類子を使用している場合は、ROCRを確認することができます。
2011

私はROCRでROC曲線を作成しました
Vladimir Chupakhin
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