期待値0のカイ2乗検定

私の分割表：

         heterozygous homozygous.minor homozygous.major
observed    2                 0               3
expected    0                 0               5

予想される母集団はAA遺伝子型のみで構成されますが、観測された母集団では2つのAB遺伝子型が観察されます。このためのカイ二乗を計算するには、期待される= 0の2つのケースを無視しますか？だから私はやります：

$(3-5)^2/5=0.8$

chi-squared

— クライシス405
ソース

期待値が実際にゼロで、観測値がゼロでない場合、カイ2乗値は無限大になります。これは本来の状態です。モデルによっては不可能であるため、自動的に拒否されます。おそらく、期待値がどのようにして得られたのかについてもっと説明する必要があります。

— Glen_b-モニカを2013

無限であるか1.6であるかは、予想される値が0であるか、それが不可能であるか、またはその他の理由であるかどうかに依存します。私はあなたの最後の文に同意します。

— Peter Flom

@PeterFlom私は統計に寄与する左端のセルを参照していました。

χ^{2}

$\chi^2$

(2 - 0)^{2} / 0 = 4 / 0

$(2-0)^2/0 = 4/0$

— Glen_b-2013

ここでの核心は、予想される周波数がどのように計算されたかに残ります。そうでなければ、すべての証拠は、おそらく不可能であったことが起こったことを示しています。これを報告する方法の選択肢があります。仮説を却下する必要があると言いたい場合や、テストが単に適用されない可能性が高いと言いたい場合があります。

— Nick Cox

はい、あなたたちは正しいです。2つのヘテロ接合体はメンデル的なエラーであり、不可能です。

— crysis405 2013年

（統計的な理由ではなく）何らかの理由がある場合にのみ、0を無視します。（0-0）はもちろん0なので、これを含めると自由度のみが変更されます。ただし、ここでカイ2乗が必要かどうかはわかりません。それは、なぜAA遺伝子型のみを期待していたかによります。

カイ2乗が必要な場合は、

$\frac{(2-0)^2}{0} + \frac{(3-5)^2}{5} = \infty$

— ピーター・フロム
ソース

セル数が少ない場合、ChiSquare近似は無効です。多項確率分布を使用して、フィッシャーの正確確率検定を試してください。

ウィキ：https : //en.wikipedia.org/wiki/Fisher%27s_exact_test

— RLロジャース
ソース