バックグラウンド
Epstein(1991)の論文では、毎月の平均値から毎日の気候値を取得する際に、定周期および等間隔の値のフーリエ補間を計算するための公式とアルゴリズムが示されています。
この論文では、補間によって月次平均から日次値を取得することが目標です。
要するに、未知の毎日の値は調和成分の合計で表すことができると仮定されます: 紙で Tヶ月で表される(時間)。
多少の偏差の後、項は次のように計算できることが示されます: ここで、YTは月の平均、Tは月の平均を示します。
Harzallah(1995)は、このアプローチを次のように要約しています。 」
ご質問
私の目標は、上記の方法論を使用して週次平均を補間し、日次データを取得することです(前の質問を参照)。要約すると、カウントデータの週平均は835です(質問の最後にあるサンプルデータセットを参照)。上で概説したアプローチを適用する前に理解できないことがかなりあります。
- 状況に応じて数式をどのように変更する必要がありますか(毎月の値ではなく毎週)?
- 時間どのように表現できますか?私はt / 835(または一般にn個のデータポイントを持つt / n)を想定しましたが、それは正しいですか?
- なぜ著者の計算7項(すなわち)?いくつの用語を検討する必要がありますか?
- 質問はおそらく回帰アプローチを使用し、補間の予測を使用することで解決できることを理解しています(Nickに感謝)。それでも、いくつかのことは私には不明確です:回帰に含まれるべき高調波の項はいくつですか?そして、どの期間を取るべきですか?毎週の平均が確実に維持されるように回帰を行うにはどうすればよいですか(データに正確な調和フィットが必要ないため)。
正確な調和フィットのプロットは次のとおりです。
編集
使い方信号パッケージとinterp1
機能を、ここで私は(@noumenalに多くのおかげで)以下からセットの例データを使用して行うことができたものです。私q=7
たちは毎週のデータを持っているので使用します:
# Set up the time scale
daily.ts <- seq(from=as.Date("1995-01-01"), to=as.Date("2010-12-31"), by="day")
# Set up data frame
ts.frame <- data.frame(daily.ts=daily.ts, wdayno=as.POSIXlt(daily.ts)$wday,
yearday = 1:5844,
no.influ.cases=NA)
# Add the data from the example dataset called "my.dat"
ts.frame$no.influ.cases[ts.frame$wdayno==3] <- my.dat$case
# Interpolation
case.interp1 <- interp1(x=ts.frame$yearday[!is.na(ts.frame$no.influ.case)],y=(ts.frame$no.influ.cases[!is.na(ts.frame$no.influ.case)]),xi=ts.frame$yearday, method = c("cubic"))
# Plot subset for better interpretation
par(bg="white", cex=1.2, las=1)
plot((ts.frame$no.influ.cases)~ts.frame$yearday, pch=20,
col=grey(0.4),
cex=1, las=1,xlim=c(0,400), xlab="Day", ylab="Influenza cases")
lines(case.interp1, col="steelblue", lwd=1)
ここには2つの問題があります。
- 曲線は「良すぎる」に適合しているようです。すべての点を通過します
- 毎週の平均は保存されていません
データセットの例
structure(list(date = structure(c(9134, 9141, 9148, 9155, 9162,
9169, 9176, 9183, 9190, 9197, 9204, 9211, 9218, 9225, 9232, 9239,
9246, 9253, 9260, 9267, 9274, 9281, 9288, 9295, 9302, 9309, 9316,
9323, 9330, 9337, 9344, 9351, 9358, 9365, 9372, 9379, 9386, 9393,
9400, 9407, 9414, 9421, 9428, 9435, 9442, 9449, 9456, 9463, 9470,
9477, 9484, 9491, 9498, 9505, 9512, 9519, 9526, 9533, 9540, 9547,
9554, 9561, 9568, 9575, 9582, 9589, 9596, 9603, 9610, 9617, 9624,
9631, 9638, 9645, 9652, 9659, 9666, 9673, 9680, 9687, 9694, 9701,
9708, 9715, 9722, 9729, 9736, 9743, 9750, 9757, 9764, 9771, 9778,
9785, 9792, 9799, 9806, 9813, 9820, 9827, 9834, 9841, 9848, 9855,
9862, 9869, 9876, 9883, 9890, 9897, 9904, 9911, 9918, 9925, 9932,
9939, 9946, 9953, 9960, 9967, 9974, 9981, 9988, 9995, 10002,
10009, 10016, 10023, 10030, 10037, 10044, 10051, 10058, 10065,
10072, 10079, 10086, 10093, 10100, 10107, 10114, 10121, 10128,
10135, 10142, 10149, 10156, 10163, 10170, 10177, 10184, 10191,
10198, 10205, 10212, 10219, 10226, 10233, 10240, 10247, 10254,
10261, 10268, 10275, 10282, 10289, 10296, 10303, 10310, 10317,
10324, 10331, 10338, 10345, 10352, 10359, 10366, 10373, 10380,
10387, 10394, 10401, 10408, 10415, 10422, 10429, 10436, 10443,
10450, 10457, 10464, 10471, 10478, 10485, 10492, 10499, 10506,
10513, 10520, 10527, 10534, 10541, 10548, 10555, 10562, 10569,
10576, 10583, 10590, 10597, 10604, 10611, 10618, 10625, 10632,
10639, 10646, 10653, 10660, 10667, 10674, 10681, 10688, 10695,
10702, 10709, 10716, 10723, 10730, 10737, 10744, 10751, 10758,
10765, 10772, 10779, 10786, 10793, 10800, 10807, 10814, 10821,
10828, 10835, 10842, 10849, 10856, 10863, 10870, 10877, 10884,
10891, 10898, 10905, 10912, 10919, 10926, 10933, 10940, 10947,
10954, 10961, 10968, 10975, 10982, 10989, 10996, 11003, 11010,
11017, 11024, 11031, 11038, 11045, 11052, 11059, 11066, 11073,
11080, 11087, 11094, 11101, 11108, 11115, 11122, 11129, 11136,
11143, 11150, 11157, 11164, 11171, 11178, 11185, 11192, 11199,
11206, 11213, 11220, 11227, 11234, 11241, 11248, 11255, 11262,
11269, 11276, 11283, 11290, 11297, 11304, 11311, 11318, 11325,
11332, 11339, 11346, 11353, 11360, 11367, 11374, 11381, 11388,
11395, 11402, 11409, 11416, 11423, 11430, 11437, 11444, 11451,
11458, 11465, 11472, 11479, 11486, 11493, 11500, 11507, 11514,
11521, 11528, 11535, 11542, 11549, 11556, 11563, 11570, 11577,
11584, 11591, 11598, 11605, 11612, 11619, 11626, 11633, 11640,
11647, 11654, 11661, 11668, 11675, 11682, 11689, 11696, 11703,
11710, 11717, 11724, 11731, 11738, 11745, 11752, 11759, 11766,
11773, 11780, 11787, 11794, 11801, 11808, 11815, 11822, 11829,
11836, 11843, 11850, 11857, 11864, 11871, 11878, 11885, 11892,
11899, 11906, 11913, 11920, 11927, 11934, 11941, 11948, 11955,
11962, 11969, 11976, 11983, 11990, 11997, 12004, 12011, 12018,
12025, 12032, 12039, 12046, 12053, 12060, 12067, 12074, 12081,
12088, 12095, 12102, 12109, 12116, 12123, 12130, 12137, 12144,
12151, 12158, 12165, 12172, 12179, 12186, 12193, 12200, 12207,
12214, 12221, 12228, 12235, 12242, 12249, 12256, 12263, 12270,
12277, 12284, 12291, 12298, 12305, 12312, 12319, 12326, 12333,
12340, 12347, 12354, 12361, 12368, 12375, 12382, 12389, 12396,
12403, 12410, 12417, 12424, 12431, 12438, 12445, 12452, 12459,
12466, 12473, 12480, 12487, 12494, 12501, 12508, 12515, 12522,
12529, 12536, 12543, 12550, 12557, 12564, 12571, 12578, 12585,
12592, 12599, 12606, 12613, 12620, 12627, 12634, 12641, 12648,
12655, 12662, 12669, 12676, 12683, 12690, 12697, 12704, 12711,
12718, 12725, 12732, 12739, 12746, 12753, 12760, 12767, 12774,
12781, 12788, 12795, 12802, 12809, 12816, 12823, 12830, 12837,
12844, 12851, 12858, 12865, 12872, 12879, 12886, 12893, 12900,
12907, 12914, 12921, 12928, 12935, 12942, 12949, 12956, 12963,
12970, 12977, 12984, 12991, 12998, 13005, 13012, 13019, 13026,
13033, 13040, 13047, 13054, 13061, 13068, 13075, 13082, 13089,
13096, 13103, 13110, 13117, 13124, 13131, 13138, 13145, 13152,
13159, 13166, 13173, 13180, 13187, 13194, 13201, 13208, 13215,
13222, 13229, 13236, 13243, 13250, 13257, 13264, 13271, 13278,
13285, 13292, 13299, 13306, 13313, 13320, 13327, 13334, 13341,
13348, 13355, 13362, 13369, 13376, 13383, 13390, 13397, 13404,
13411, 13418, 13425, 13432, 13439, 13446, 13453, 13460, 13467,
13474, 13481, 13488, 13495, 13502, 13509, 13516, 13523, 13530,
13537, 13544, 13551, 13558, 13565, 13572, 13579, 13586, 13593,
13600, 13607, 13614, 13621, 13628, 13635, 13642, 13649, 13656,
13663, 13670, 13677, 13684, 13691, 13698, 13705, 13712, 13719,
13726, 13733, 13740, 13747, 13754, 13761, 13768, 13775, 13782,
13789, 13796, 13803, 13810, 13817, 13824, 13831, 13838, 13845,
13852, 13859, 13866, 13873, 13880, 13887, 13894, 13901, 13908,
13915, 13922, 13929, 13936, 13943, 13950, 13957, 13964, 13971,
13978, 13985, 13992, 13999, 14006, 14013, 14020, 14027, 14034,
14041, 14048, 14055, 14062, 14069, 14076, 14083, 14090, 14097,
14104, 14111, 14118, 14125, 14132, 14139, 14146, 14153, 14160,
14167, 14174, 14181, 14188, 14195, 14202, 14209, 14216, 14223,
14230, 14237, 14244, 14251, 14258, 14265, 14272, 14279, 14286,
14293, 14300, 14307, 14314, 14321, 14328, 14335, 14342, 14349,
14356, 14363, 14370, 14377, 14384, 14391, 14398, 14405, 14412,
14419, 14426, 14433, 14440, 14447, 14454, 14461, 14468, 14475,
14482, 14489, 14496, 14503, 14510, 14517, 14524, 14531, 14538,
14545, 14552, 14559, 14566, 14573, 14580, 14587, 14594, 14601,
14608, 14615, 14622, 14629, 14636, 14643, 14650, 14657, 14664,
14671, 14678, 14685, 14692, 14699, 14706, 14713, 14720, 14727,
14734, 14741, 14748, 14755, 14762, 14769, 14776, 14783, 14790,
14797, 14804, 14811, 14818, 14825, 14832, 14839, 14846, 14853,
14860, 14867, 14874, 14881, 14888, 14895, 14902, 14909, 14916,
14923, 14930, 14937, 14944, 14951, 14958, 14965, 14972), class = "Date"),
cases = c(168L, 199L, 214L, 230L, 267L, 373L, 387L, 443L,
579L, 821L, 1229L, 1014L, 831L, 648L, 257L, 203L, 137L, 78L,
82L, 69L, 45L, 51L, 45L, 63L, 55L, 54L, 52L, 27L, 24L, 12L,
10L, 22L, 42L, 32L, 52L, 82L, 95L, 91L, 104L, 143L, 114L,
100L, 83L, 113L, 145L, 175L, 222L, 258L, 384L, 755L, 976L,
879L, 846L, 1004L, 801L, 799L, 680L, 530L, 410L, 302L, 288L,
234L, 269L, 245L, 240L, 176L, 188L, 128L, 96L, 59L, 63L,
44L, 52L, 39L, 50L, 36L, 40L, 48L, 32L, 39L, 28L, 29L, 16L,
20L, 25L, 25L, 48L, 57L, 76L, 117L, 107L, 91L, 90L, 83L,
76L, 86L, 104L, 101L, 116L, 120L, 185L, 290L, 537L, 485L,
561L, 1142L, 1213L, 1235L, 1085L, 1052L, 987L, 918L, 746L,
620L, 396L, 280L, 214L, 148L, 148L, 94L, 107L, 69L, 55L,
69L, 47L, 43L, 49L, 30L, 42L, 51L, 41L, 39L, 40L, 38L, 22L,
37L, 26L, 40L, 56L, 54L, 74L, 99L, 114L, 114L, 120L, 114L,
123L, 131L, 170L, 147L, 163L, 163L, 160L, 158L, 163L, 124L,
115L, 176L, 171L, 214L, 320L, 507L, 902L, 1190L, 1272L, 1282L,
1146L, 896L, 597L, 434L, 216L, 141L, 101L, 86L, 65L, 55L,
35L, 49L, 29L, 55L, 53L, 57L, 34L, 43L, 42L, 13L, 17L, 20L,
27L, 36L, 47L, 64L, 77L, 82L, 82L, 95L, 107L, 96L, 106L,
93L, 114L, 102L, 116L, 128L, 123L, 212L, 203L, 165L, 267L,
550L, 761L, 998L, 1308L, 1613L, 1704L, 1669L, 1296L, 975L,
600L, 337L, 259L, 145L, 91L, 70L, 79L, 63L, 58L, 51L, 53L,
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