正および負の予測値の統計的検定


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私は論文を読んでいて、PPV(正の予測値)とNPV(負の予測値)を比較した表を見ました。彼らは彼らのためにある種の統計的検定を行いました。これはテーブルのスケッチです:

PPV    NPV    p-value
65.9   100    < 0.00001
...

すべての行は特定の分割表を参照します。

彼らはどのような仮説検定をしましたか?ありがとう!

回答:


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以下に示すようなクロス分類を想定(ここでは、スクリーニング機器)

代替テキスト

スクリーニングの精度と予測力の4つの尺度を定義できます。

  • 感度(se)、a /(a + c)、つまり、疾患が存在する場合にスクリーニングが肯定的な結果を提供する確率。
  • 特異性(sp)、d /(b + d)、つまり、疾患が存在しない場合にスクリーニングが陰性結果を提供する確率。
  • 陽性的中率(PPV)、a /(a + b)、すなわち、検査結果が陽性であり、正しく診断された(陽性として)患者の確率。
  • 負の予測値(NPV)、d /(c + d)、つまり、検査結果が陰性で、正しく診断された(陰性として)患者の確率。

4つの各測定値は、観測データから計算された単純な比率です。したがって、適切な統計的検定は、ほとんどの統計パッケージまたは多くのオンライン計算機で利用できる二項(正確な)検定です。テストされた仮説は、観測された比率が0.5と有意に異なるかどうかです。ただし、測定の精度に関する情報を提供するため、単一の有意性検定よりも信頼区間を提供する方がより興味深いことがわかりました。とにかく、表示した結果を再現するには、双方向テーブルの総マージンを知る必要があります(PPVとNPVを%で指定しただけです)。

例として、次のデータを観察するとします(CAGEアンケートはアルコールのスクリーニングアンケートです)。

代替テキスト

Rでは、PPVは次のように計算されます。

> binom.test(99, 142)

    Exact binomial test

data:  99 and 142 
number of successes = 99, number of trials = 142, p-value = 2.958e-06
alternative hypothesis: true probability of success is not equal to 0.5 
95 percent confidence interval:
 0.6145213 0.7714116 
sample estimates:
probability of success 
             0.6971831 

SASを使用している場合、使用上の注意24170:感度、特異性、正および負の予測値、偽陽性および負の確率、および尤度比を推定するにはどうすればよいですか?

信頼区間を計算するには、ガウス近似、 p±1.96×p1p/n (1.96は、標準正規分布の分位数です。 p=0.975 または 1α/2α=5%)は、特に比率が非常に小さいか大きい場合に実際に使用されます(多くの場合ここにあります)。

詳細については、次をご覧ください。

ニューカム、RG。シングル割合を両面信頼区間:七つの方法の比較Statistics in Medicine、17、857-872(1998)。


ありがとう。さて、私は論文の冒頭で、すべてのカテゴリー変数にカイ二乗検定を使用したことを読みました。作成された分類テーブルは、特に変数を参照するものではなく、分類タスクの出力です。あまり明確ではありません!今、私は彼らがプロポーションの古典的なテストを行ったと思います。多分カイ二乗
シモーヌ

この質問をもう一度見て、p値がPPVもNPVも参照せず、行全体を参照していることを確認しました。彼らが行ったテストは、コンティンジェンシーテーブル全体に関連付けられるべきだと思います。
シモーヌ

@Simoneそれで、私があなたを正しく理解しているなら、著者はPPVとNPV値を提供するが、2x2テーブルのグローバルな関連付けテストに対応するp値を与えたことを提案しますか?この最近の質問stats.stackexchange.com/questions/9464/…に関連していますか?
-chl

はい、p値がPPVまたはNPVに関連付けられているかどうかは、その質問に関連しています。そしてその場合、あなたは解決策を与えました。テストは2x2テーブル全体に対応します。どのようなテストであるかはわかりません。
シモーネ

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