私はRパッケージnlmeおよびlme4で作業し、複数のランダム効果を持つモデルを指定しようとしました。分散の異種構造を指定できるのはnlmeのみであることがわかりました。したがって、温度(Y)が時間(時間)に依存し、インターセプトが日付と年によって異なり、分散も年によって異なるモデルを取得しました。
fit1 <- lme(Y ~ time, random=~1|year/date, data=X, weights=varIdent(form=~1|year))
ただし、別のランダムな用語(日付によって異なる時間)を追加する必要がある場合、次のようにモデルを指定します。
fit2 <- lme(Y ~ time, random=list(~1|year, ~time-1|date, ~1|date), data=X,
weights=varIdent(form=~1|year))
ランダム効果は互いに入れ子になります。年の日付。そして、日付と年の日付。
私も試しました
one <- rep(1, length(Y))
fit3 <- lme(Y ~ time, random=list(one=pdBlocked(list(pdSymm(~1|year/date),
pdSymm(~time-1|year)))), data=X, weights=varIdent(form=~1|year))
ただし、エラーが発生します。
Error in pdConstruct.pdBlocked(object, form = form, nam = nam, data = data, :
cannot have duplicated column names in a "pdMat" object
同様の問題に関連する質問がすでに多くあることは理解していますが、私の場合の答えは本当に見つかりませんでした。モデルの適切な仕様を教えてください。