ガンマ分布でGLMにRを使用する


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現在、ガンマ分布を使用してGLMを近似するためのRの構文を理解するのに問題があります。

データのセットがあり、各行には3つの共変量()、応答変数(Y)、および形状パラメーター(K)が含まれています。ガンマ分布のスケールを3つの共変量の線形関数としてモデル化したいのですが、データの各行に対して分布の形状をKに設定する方法がわかりません。X1,X2,X3YKK

私が似ていると思う状況は、二項分布の場合、GLMでは各データエントリについて試行回数()がわかっている必要があるということです。N

回答:


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通常のガンマGLMには、通常の線形モデルが一定の分散を仮定するのと同じように、形状パラメーターが一定であるという仮定が含まれています。

GLMの用語で分散パラメータ、ヴァーY I= φ Vはμ I通常一定です。ϕVar(Yi)=ϕV(μi)

より一般的にはありますがそれは役に立ちません。a(ϕ)

重み付きガンマGLMを使用して、指定された形状パラメーターのこの効果を組み込むことはおそらく可能かもしれませんが、この可能性についてはまだ調査していません(機能する場合はおそらく最も簡単な方法ですが、私はまったくそうではありませんそれが確実になります)。

ダブルGLMがある場合、共変量の関数としてそのパラメーターを推定できます...そして、ダブルglmソフトウェアで分散項のオフセットを指定できる場合、これを行うことができます。dglmパッケージ内の関数でdglmオフセットを指定できるように見えます。~ offset(<something>) + 0ただし、(たとえば)のような分散モデルを指定できるかどうかはわかりません。

別の選択肢は、尤度を直接最大化することです。


> y <- rgamma(100,10,.1)

> summary(glm(y~1,family=Gamma))

Call:
glm(formula = y ~ 1, family = Gamma)

Deviance Residuals: 
     Min        1Q    Median        3Q       Max  
-0.93768  -0.25371  -0.05188   0.16078   0.81347  

Coefficients:
             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
(Intercept) 0.0103660  0.0003486   29.74   <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1

(Dispersion parameter for Gamma family taken to be 0.1130783) 

    Null deviance: 11.223  on 99  degrees of freedom
Residual deviance: 11.223  on 99  degrees of freedom
AIC: 973.56

Number of Fisher Scoring iterations: 5

それが言う行:

   (Dispersion parameter for Gamma family taken to be 0.1130783)

あなたが望むものです。

それφは、ガンマの形状パラメータに関係しています。ϕ^


1
ϕ=KKKβK

μMASS

glm(V4 ~ V3 + V2 + V1, family=Gamma)V1,V2,V3V4β

1
ϕ^

1
βVθ=(βTV)1YGamma(5,θ)β^β
ジョンクロース

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その後、Balajari(2013)で説明されているMASSパッケージのgamma.shape関数を使用して、後で形状パラメーターを推定し、GLMで係数の推定と予測を調整しました。私の意見では、GLMでのガンマ分布の使用に関して、非常に明確で興味深い講演を読むことをお勧めします。

glmGamma <- glm(response ~ x1, family = Gamma(link = "identity")
library(MASS)
myshape <- gamma.shape(glmGamma)
gampred <- predict(glmGamma , type = "response", se = T, dispersion = 1/myshape$alpha) 
    summary(glmGamma, dispersion = 1/myshape$alpha)
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