BUGSとRのパラメーター化が異なる正規分布、対数正規分布、ワイブル分布を見つけました。
これらのそれぞれについて、Rが使用する2番目のパラメーターは、BUGS(または私の場合はJAGS)で使用する前に逆変換(1 /パラメーター)する必要があることを収集します。
現在存在するこれらの変換の包括的なリストを知っている人はいますか?
私が見つけることができる最も近いものは、JAGS 2.2.0ユーザーマニュアルの表7の分布を、?rnorm
等の結果と、おそらくいくつかの確率テキストと比較することです。このアプローチでは、変換をPDFから個別に推定する必要があるようです。
このタスク(および起こりうるエラー)が既に行われている場合は回避するか、ここからリストを開始します。
更新
Benの提案に基づいて、パラメーターのデータフレームをRからBUGSパラメーター化に変換する次の関数を作成しました。
##' convert R parameterizations to BUGS paramaterizations
##'
##' R and BUGS have different parameterizations for some distributions.
##' This function transforms the distributions from R defaults to BUGS
##' defaults. BUGS is an implementation of the BUGS language, and these
##' transformations are expected to work for bugs.
##' @param priors data.frame with colnames c('distn', 'parama', 'paramb')
##' @return priors with jags parameterizations
##' @author David LeBauer
r2bugs.distributions <- function(priors) {
norm <- priors$distn %in% 'norm'
lnorm <- priors$distn %in% 'lnorm'
weib <- priors$distn %in% 'weibull'
bin <- priors$distn %in% 'binom'
## Convert sd to precision for norm & lnorm
priors$paramb[norm | lnorm] <- 1/priors$paramb[norm | lnorm]^2
## Convert R parameter b to JAGS parameter lambda by l = (1/b)^a
priors$paramb[weib] <- 1 / priors$paramb[weib]^priors$parama[weib]
## Reverse parameter order for binomial
priors[bin, c('parama', 'paramb')] <- priors[bin, c('parama', 'paramb')]
## Translate distribution names
priors$distn <- gsub('weibull', 'weib',
gsub('binom', 'bin',
gsub('chisq', 'chisqr',
gsub('nbinom', 'negbin',
as.vector(priors$distn)))))
return(priors)
}
##' @examples
##' priors <- data.frame(distn = c('weibull', 'lnorm', 'norm', 'gamma'),
##' parama = c(1, 1, 1, 1),
##' paramb = c(2, 2, 2, 2))
##' r2bugs.distributions(priors)