最近公開された記事の結果を再現しようとすると、
アギオン、フィリップ、ジョンヴァンリーネン、ルイージジンガレス。2013.「イノベーションと制度的所有権」。American Economic Review、103(1):277-304。
(データとスタタのコードは、http: //www.aeaweb.org/aer/data/feb2013/20100973_data.zipで入手できます)。
Rの最初の5つの回帰を(OLSとポアソン法を使用して)再作成しても問題はありませんが、Rで負の二項回帰結果を再作成できません。
具体的には、ここで私が作成したRコードは、データに対して負の二項回帰を実行できません。
library(foreign)
library(MASS)
data.AVRZ <- read.dta("results_data2011.dta",
convert.underscore=TRUE)
sicDummies <- grep("Isic4", names(data.AVRZ), value=TRUE)
yearDummies <- grep("Iyear", names(data.AVRZ), value=TRUE)
data.column.6 <- subset(data.AVRZ, select = c("cites",
"instit.percown",
"lk.l",
"lsal",
sicDummies,
yearDummies))
data.column.6 <- na.omit(data.column.6)
glm.nb(cites ~ .,
data = data.column.6,
link = log,
control=glm.control(trace=10,maxit=100))
上記をRで実行すると、次の出力が得られます。
Initial fit:
Deviance = 1137144 Iterations - 1
Deviance = 775272.3 Iterations - 2
Deviance = 725150.7 Iterations - 3
Deviance = 722911.3 Iterations - 4
Deviance = 722883.9 Iterations - 5
Deviance = 722883.3 Iterations - 6
Deviance = 722883.3 Iterations - 7
theta.ml: iter 0 'theta = 0.000040'
theta.ml: iter1 theta =7.99248e-05
Initial value for 'theta': 0.000080
Deviance = 24931694 Iterations - 1
Deviance = NaN Iterations - 2
Step halved: new deviance = 491946.5
Error in glm.fitter(x = X, y = Y, w = w, etastart = eta, offset = offset, :
NA/NaN/Inf in 'x'
In addition: Warning message:
step size truncated due to divergence
シータにいくつかの異なる初期値を使用したり、運のない最大反復回数を変えたりしてみました。著者が提供したstataコードは問題なく機能しますが、モデルを機能させるためにRを強制することはできません。glm.nb()の代替のフィッティングメソッドはありますか?
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少ない変数で収束しますが、すべてではありません-変数が多く、非常に醜い結果変数があります。おそらく1日か2日以内に返信がない場合は、r-help @ r-project.orgに電子メールを送信してください。
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user20650 2013年
最終的に、ポアソン回帰を実行して開始パラメーター値を取得し、これらを対数尤度関数のMLEに供給することで、これを推定することができました。これに対する解決策を間もなく投稿します。
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jayb
@jaybあなたの解決策を見てみたい
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アンディ
@jayb私はあなたの解決策を見てみたい:)
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KH Kim
@jaybこの質問は死んでいるか、他の場所で回答されていますか?
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デイブフルニエ、2015年