最近公開された記事の結果を再現しようとすると、
アギオン、フィリップ、ジョンヴァンリーネン、ルイージジンガレス。2013.「イノベーションと制度的所有権」。American Economic Review、103(1):277-304。
(データとスタタのコードは、http: //www.aeaweb.org/aer/data/feb2013/20100973_data.zipで入手できます)。
Rの最初の5つの回帰を(OLSとポアソン法を使用して)再作成しても問題はありませんが、Rで負の二項回帰結果を再作成できません。
具体的には、ここで私が作成したRコードは、データに対して負の二項回帰を実行できません。
library(foreign)
library(MASS)
data.AVRZ <- read.dta("results_data2011.dta",
                  convert.underscore=TRUE)
sicDummies <- grep("Isic4", names(data.AVRZ), value=TRUE)
yearDummies <- grep("Iyear", names(data.AVRZ), value=TRUE)
data.column.6 <- subset(data.AVRZ, select = c("cites",
                                 "instit.percown",
                                 "lk.l",
                                 "lsal",
                                 sicDummies,
                                 yearDummies))
data.column.6 <- na.omit(data.column.6)
glm.nb(cites ~ .,
   data = data.column.6,
   link = log,
   control=glm.control(trace=10,maxit=100))上記をRで実行すると、次の出力が得られます。
Initial fit:
Deviance = 1137144 Iterations - 1 
Deviance = 775272.3 Iterations - 2 
Deviance = 725150.7 Iterations - 3 
Deviance = 722911.3 Iterations - 4 
Deviance = 722883.9 Iterations - 5 
Deviance = 722883.3 Iterations - 6 
Deviance = 722883.3 Iterations - 7 
theta.ml: iter 0 'theta = 0.000040'
theta.ml: iter1 theta =7.99248e-05
Initial value for 'theta': 0.000080
Deviance = 24931694 Iterations - 1 
Deviance = NaN Iterations - 2 
Step halved: new deviance = 491946.5 
Error in glm.fitter(x = X, y = Y, w = w, etastart = eta, offset = offset,  : 
NA/NaN/Inf in 'x'
In addition: Warning message:
step size truncated due to divergenceシータにいくつかの異なる初期値を使用したり、運のない最大反復回数を変えたりしてみました。著者が提供したstataコードは問題なく機能しますが、モデルを機能させるためにRを強制することはできません。glm.nb()の代替のフィッティングメソッドはありますか?
                
                1
              
                  少ない変数で収束しますが、すべてではありません-変数が多く、非常に醜い結果変数があります。おそらく1日か2日以内に返信がない場合は、r-help @ r-project.orgに電子メールを送信してください。
                
                
                  
                    —
                    user20650 2013年
                    
                  
                
              
                  最終的に、ポアソン回帰を実行して開始パラメーター値を取得し、これらを対数尤度関数のMLEに供給することで、これを推定することができました。これに対する解決策を間もなく投稿します。
                
                
                  
                    —
                    jayb 
                    
                  
                
              
                  @jaybあなたの解決策を見てみたい
                
                
                  
                    —
                    アンディ
                    
                  
                
              
                  @jayb私はあなたの解決策を見てみたい:)
                
                
                  
                    —
                    KH Kim 
                    
                  
                
              
                  @jaybこの質問は死んでいるか、他の場所で回答されていますか?
                
                
                  
                    —
                    デイブフルニエ、2015年