2つの異なる条件下でのmRNAの経時的な分解率を表す2つの線形回帰モデルを比較したいと思います。各モデルのデータは個別に収集されました。
これがデータセットです。
時間(時間)ログ(処理A)ログ(処理B) 0 2.02 1.97 0 2.04 2.06 0 1.93 1.96 2 2.02 1.91 2 2.00 1.95 2 2.07 1.82 4 1.96 1.97 4 2.02 1.99 4 2.02 1.99 6 1.94 1.90 6 1.94 1.97 6 1.86 1.88 8 1.93 1.97 8 2.12 1.99 8 2.06 1.93 12 1.71 1.70 12 1.96 1.73 12 1.71 1.76 24 1.70 1.46 24 1.83 1.41 24 1.62 1.42
これらは私のモデルです:
Exp1.A.lm<-lm(Exp1$Time~Exp1$(Treatment A))
Exp1.B.lm<-lm(Exp1$Time~Exp1$(Treatment B))
コール: lm(式= Exp1 $ Time〜Exp1 $(治療A)) 残差: 最小1Q中央値3Q最大 -6.8950 -1.2322 0.2862 1.2494 5.2494 係数: 標準の見積もり エラーt値Pr(> | t |) (切片)74.68 6.27 11.91 2.94e-10 *** Exp1 $(処理A)-36.14 3.38 -10.69 1.77e-09 *** --- シグニフ。コード:0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '。' 0.1 '' 1 残差標準誤差:19自由度で2.97 複数のR二乗:0.8575、調整済みR二乗:0.85 F統計:14.3と1 DFで114.3、p値:1.772e-09 コール: lm(式= Exp1 $ Time〜Exp1 $(治療B)) 残差: 最小1Q中央値3Q最大 -7.861 -3.278 -1.444 3.222 11.972 係数: 標準の見積もり エラーt値Pr(> | t |) (切片)88.281 16.114 5.478 2.76e-05 *** Exp1 $(治療B)-41.668 8.343 -4.994 8.05e-05 *** --- シグニフ。コード:0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '。' 0.1 '' 1 残差標準誤差:19自由度で5.173 複数のR二乗:0.5676、調整済みR二乗:0.5449 F統計:1と19 DFで24.94、p値:8.052e-05
これら2つのモデルを比較するために、次のコードを使用しました。
anova(Exp1.A.lm,Exp1.B.lm)
分散分析表 モデル1:Exp1 $ Time〜Exp1 $ Exp1 $(治療A) モデル2:Exp1 $時間〜Exp1 $ Exp1 $(処理B) Res.Df RSS Df Sq F Pr(> F)の合計 1 19 167.60 2 19 508.48 0 -340.88
私の質問は、ANOVA分析がF統計量とp.valを示さない理由です。これがナイーブな質問であるかどうか、私の謝罪
異なる勾配に基づいて、これらの2つのモデルでは劣化の速度が異なりますが、この違いが統計的にどれほど重要であるかを知りたいと思います。これが理にかなっているといいのですが。
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分散分析表に、分析に関連する自由度が0としてリストされていることに気付くでしょう。両方のモデルに同じ数の変数があるため、Fまたはp値を計算できません。
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gung-モニカの復活
これらのモデルを比較して、それらの適合度を確認するまで気にしません。2つ目の例では、応答もその対数も時間の線形関数ではないことがわかります。これは、(真剣に)勾配推定値の比較に疑問を投げかけます。
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whuber