状態空間モデル(SSM)に関連して、カルマンフィルター(KF)手法を通じてスプラインを使用する方法を説明します。一部のスプラインモデルがSSMで表され、KFで計算できるという事実は、1980年から1990年にかけてCFアンスリーとR.コーンによって明らかにされました。推定関数とその導関数は、観測を条件とする状態の期待値です。これらの推定値は、SSMを使用する場合の定型タスクである固定間隔平滑化を使用して計算されます。
簡略化のため、観察は時間で行われることを前提としt1<t2<⋯<tnと観測番号ことkで
tk唯一伴う1オーダー有する誘導体dkで
{0,1,2}。モデルの観測部分は、y(tk)=f[dk](tk)+ε(tk)(O1)
て書き込みます。
ここで、f(t)は観測されていない真の関数を示し、ε(tk)
は派生次数 d kに応じた分散H(tk)dk。(連続時間)遷移方程式は、一般形式
ddtα(t)=Aα(t)+η(t)(T1)
α(t)未観測状態ベクトルとされる
η(t)共分散を有するガウス白色雑音である、から独立であると仮定観測ノイズr.vs。スプラインを記述するために、
一次導関数を積み重ねることによって得られる状態、つまり Qε(tk)mα(t):=[f(t),f[1](t),…,f[m−1](t)]⊤[ f [ 1 ](t )f [ 2 ](t )⋮ f [ m − 1 ](t )f [ m ](t ) ] = [ 0 1 0。遷移は
そして、次数(および次数)の多項式スプラインを取得し
ます。一方、⎡⎣⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢f[1](t)f[2](t)⋮f[m−1](t)f[m](t)⎤⎦⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥=⎡⎣⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢00⋮010…01⋱10⎤⎦⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎡⎣⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢f(t)f[1](t)⋮f[m−2](t)f[m−1](t)⎤⎦⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥+⎡⎣⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢00⋮0η(t)⎤⎦⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥
2M2、M-1m=2>1 y (t k) 2m2m−1m=2通常の3次スプラインに対応し、次数導関数を使用するには高次が必要です。古典的なSSM形式に固執するために、(O1)を
ここで、観測行列はの適切な導関数を選択し、の分散は
応じて選択され。だからここで、
>1y(tk)=Z(tk)α(tk)+ε(tk),(O2)
Z(tk)α(tk)H(tk)ε(tk)dkZ(tk)=Z⋆dk+1Z⋆1:=[1,0,…,0]Z⋆2:=[0,1,…0]Z ⋆ 3:= [ 0 、および。同様に、3つの分散、
、および、です。 Z⋆3:=[0,0,1,0,…]H(tk)= H⋆dk+ 1H⋆1H⋆2H⋆3
遷移は連続時間ですが、KFは実際には標準の離散時間です。確かに、実際には、観測がある、またはデリバティブを推定したい時刻に焦点を当てます。集合をこれらの2つの時間の和集合として、での観測値が欠落していると想定できます。これにより、観測値の存在に関係なく、で微分
を推定できます。個別のSSMを導出する必要があります。t{ tk}tkmtk
離散時間にインデックスを使用し、を
書き込みます。離散時間SSMは、の形式を取ります。
ここで、行列そして(T1)に由来し、(O2)を分散しながらによって与えられる
は、αkα (tk)αk + 1yk= Tkαk+ η⋆k= Zkαk+ εk(DT)
TkQ⋆k:= Var (η⋆k)εkHk=H⋆dk+1ykTK=EXP{δKA}=[ 1 δ 1 K欠落していません。代数を使用して、離散時間SSMの遷移行列を見つけることができます
where for。同様に、離散時間SSM の共分散行列は、
Tk=exp{δkA}=⎡⎣⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢⎢10⋮0δ1k1!1…δ2k2!δ1k1!…⋱δm−1k(m−1)!δ1k1!1⎤⎦⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥⎥,
δk:= tk + 1− tkk < nQ⋆k= Var (η⋆k)Q⋆k= σ2η[ δ2 m − i − j + 1k(m − i )!(m − j )!(2 m − i − j + 1 )]i 、j
ij1m
インデックスはと間にある及び。私j1m
Rで計算を引き継ぐには、KF専用のパッケージが必要であり、時変モデルを受け入れます。CRANパッケージKFASは適切なオプションのようです。我々は、行列計算するRの関数を書くことができる
と回のベクトルからは
SSM(DT)を符号化するために。パッケージで使用される表記法では、行列が(DT)の遷移方程式のノイズを乗算する
ようになります。ここで、アイデンティティ。また、ここでは拡散初期共分散を使用する必要があることに注意してください。TkQ⋆ktkRkη⋆k私m
EDIT当初書かれたように間違っていました。修正済み(Rコードおよび画像でも同様)。Q⋆
CFアンスリーとR.コーン(1986)「スプライン平滑化への2つの確率的アプローチの等価性について」J. Appl。プロバブ。、23、pp。391–405
R. Kohn and CF Ansley(1987)「確率過程の平滑化に基づくスプライン平滑化の新しいアルゴリズム」SIAM J. Sci。と統計。計算します。、8(1)、33〜48ページ
J.ヘルスケ(2017)。「KFAS:Rの指数関数的家族状態空間モデル」J. Stat。柔らかい。、78(10)、1-39ページ
smoothWithDer <- function(t, y, d, m = 3,
Hstar = c(3, 0.2, 0.1)^2, sigma2eta = 1.0^2) {
## define the SSM matrices, depending on 'delta_k' or on 'd_k'
Tfun <- function(delta) {
mat <- matrix(0, nrow = m, ncol = m)
for (i in 0:(m-1)) {
mat[col(mat) == row(mat) + i] <- delta^i / gamma(i + 1)
}
mat
}
Qfun <- function(delta) {
im <- (m - 1):0
x <- delta^im / gamma(im + 1)
mat <- outer(X = x, Y = x, FUN = "*")
im2 <- outer(im, im, FUN = "+")
sigma2eta * mat * delta / (im2 + 1)
}
Zfun <- function(d) {
Z <- matrix(0.0, nrow = 1, ncol = m)
Z[1, d + 1] <- 1.0
Z
}
Hfun <- function(d) ifelse(d >= 0, Hstar[d + 1], 0.0)
Rfun <- function() diag(x = 1.0, nrow = m)
## define arrays by stacking the SSM matrices. We need one more
## 'delta' at the end of the series
n <- length(t)
delta <- diff(t)
delta <- c(delta, mean(delta))
Ta <- Qa <- array(0.0, dim = c(m, m, n))
Za <- array(0.0, dim = c(1, m, n))
Ha <- array(0.0, dim = c(1, 1, n))
Ra <- array(0.0, dim = c(m, m, n))
for (k in 1:n) {
Ta[ , , k] <- Tfun(delta[k])
Qa[ , , k] <- Qfun(delta[k])
Za[ , , k] <- Zfun(d[k])
Ha[ , , k] <- Hfun(d[k])
Ra[ , , k] <- Rfun()
}
require(KFAS)
## define the SSM and perform Kalman Filtering and smoothing
mod <- SSModel(y ~ SSMcustom(Z = Za, T = Ta, R = Ra, Q = Qa, n = n,
P1 = matrix(0, nrow = m, ncol = m),
P1inf = diag(1.0, nrow = m),
state_names = paste0("d", 0:(m-1))) - 1)
out <- KFS(mod, smoothing = "state")
list(t = t, filtered = out$att, smoothed = out$alphahat)
}
## An example function as in OP
f <- function(t, d = rep(0, length = length(t))) {
f <- rep(NA, length(t))
if (any(ind <- (d == 0))) f[ind] <- 2.0 + t[ind] - 0.5 * t[ind]^2
if (any(ind <- (d == 1))) f[ind] <- 1.0 - t[ind]
if (any(ind <- (d == 2))) f[ind] <- -1.0
f
}
set.seed(123)
n <- 100
t <- seq(from = 0, to = 10, length = n)
Hstar <- c(3, 0.4, 0.2)^2
sigma2eta <- 1.0
fTrue <- cbind(d0 = f(t), d1 = f(t, d = 1), d2 = f(t, d = 2))
## ============================================================================
## use a derivative index of -1 to indicate non-observed values, where
## 'y' will be NA
##
## [RUN #0] no derivative m = 2 (cubic spline)
## ============================================================================
d0 <- sample(c(-1, 0), size = n, replace = TRUE, prob = c(0.7, 0.3))
ft0 <- f(t, d0)
## add noise picking the right sd
y0 <- ft0 + rnorm(n = n, sd = c(0.0, sqrt(Hstar))[d0 + 2])
res0 <- smoothWithDer(t, y0, d0, m = 2, Hstar = Hstar)
## ============================================================================
## [RUN #1] Only first order derivative: we can take m = 2 (cubic spline)
## ============================================================================
d1 <- sample(c(-1, 0:1), size = n, replace = TRUE, prob = c(0.7, 0.15, 0.15))
ft1 <- f(t, d1)
y1 <- ft1 + rnorm(n = n, sd = c(0.0, sqrt(Hstar))[d1 + 2])
res1 <- smoothWithDer(t, y1, d1, m = 2, Hstar = Hstar)
## ============================================================================
## [RUN #2] First and second order derivative: we can take m = 3
## (quintic spline)
## ============================================================================
d2 <- sample(c(-1, 0:2), size = n, replace = TRUE, prob = c(0.7, 0.1, 0.1, 0.1))
ft2 <- f(t, d2)
y2 <- ft2 + rnorm(n = n, sd = c(0.0, sqrt(Hstar))[d2 + 2])
res2 <- smoothWithDer(t, y2, d2, m = 3, Hstar = Hstar)
## plots : a ggplot with facets would be better here.
for (run in 0:2) {
resrun <- get(paste0("res", run))
drun <- get(paste0("d", run))
yrun <- get(paste0("y", run))
matplot(t, resrun$smoothed, pch = 16, cex = 0.7, ylab = "", xlab = "")
matlines(t, fTrue, lwd = 2, lty = 1)
for (dv in 0:2) {
points(t[drun == dv], yrun[drun == dv], cex = 1.2, pch = 22, lwd = 2,
bg = "white", col = dv + 1)
}
title(main = sprintf("run %d. Dots = smooothed, lines = true, square = obs", run))
legend("bottomleft", col = 1:3, legend = c("d0", "d1", "d2"), lty = 1)
}
splinefun
導関数を計算できます。おそらく、これを出発点として使用して、いくつかの逆手法を使用してデータを近似できますか?これに対する解決策を学ぶことに興味があります。