現在、Rパッケージlme4を使用しています。
私はランダム効果を持つ線形混合効果モデルを使用しています:
library(lme4)
mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects
mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect +
# random effects
mod3 <- lmer(r1 ~ p1 + p2 + (1 | site), data = sample_set) #Two fixed effects +
# random effects
モデルを比較するために、私はこのanova
関数を使用して、最も低いAICモデルに対するAICの違いを調べています。
anova(mod1, mod2, mod3)
上記はモデルを比較するのに適しています。
ただし、各モデルの適合度の尺度を解釈する簡単な方法も必要です。誰でもそのような措置の経験がありますか?私はいくつかの研究を行ってきましたが、混合効果モデルの固定効果に関するR 2乗に関する論文があります。
- Cheng、J.、Edwards、LJ、Maldonado-Molina、MM、Komro、KA、およびMuller、KE(2010)。実在の人々のための実際の縦断的データ分析:十分な混合モデルの構築 医学統計、29(4)、504-520。土井:10.1002 / sim.3775
- Edwards、LJ、Muller、KE、Wolfinger、RD、Qaqish、BF、およびSchabenberger、O。(2008)。線形混合モデルの固定効果のR2統計。医学統計、27(29)、6137-6157。土井:10.1002 / sim.3429
しかし、上記の論文で提案されているような対策の使用をめぐるいくつかの批判があるようです。
誰かが私のモデルに適用できる、解釈が簡単な適合度の尺度をいくつか提案していただけますか?
2
私は本当に質問等が挙げられるが、固定効果が必要とされているかどうかを判断するために尤度比検定を使用することはありません参照して、推奨戦略のFAQを。そのため、上記はモデルの比較には適していません。
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ヘンリック
ヘンリック、ありがとう。あなたがリストしたFAQはとても役に立ちます。マルコフ連鎖モンテカルロサンプリングは、私のモデルを比較するための良い戦略であると思われます。
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mjburns
ヘンリック。afexパッケージからあなたのmixed()関数を動作させることができました。モデルを比較するためにafexを使用する方法についてアドバイスしていただけますか?あるモデルが別のモデルよりも妥当であるかどうかを判断するために、どのような尺度を使用できますか?ありがとう。
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mjburns
これは簡単には答えられません。おそらく、別の質問をして詳細を教えてください。ただし、簡単に言えば、afexは特定の効果(またはこの効果を含むより優れたモデル)が重要であるかどうかの評価を支援しようとします。このため、
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ヘンリック
KRmodcomp
fromパッケージを使用しますpbkrtest
。KRmodcomp
モデルを直接比較することもできます。