HMCはマルコフ連鎖法ではないというのは間違っています。ウィキペディアごと:
数学と物理学では、ハミルトニアンモンテカルロとも呼ばれるハイブリッドモンテカルロアルゴリズムは、直接サンプリングが困難な確率分布からランダムサンプルのシーケンスを取得するマルコフ連鎖モンテカルロ法です。このシーケンスは、分布を近似する(つまり、ヒストグラムを生成する)ため、または積分(期待値など)を計算するために使用できます。
より明確にするために、NUTS終了基準について言及しているBetancourtのarXiv論文を読んでください。
...軌跡が、現在のエネルギーレベルセット周辺の近傍を十分に探索するのに十分な長さである場合を特定します。特に、ハミルトニアンの軌道を十分に活用できない場合の短すぎる積分と、減少するリターンのみをもたらす探索に貴重な計算リソースを浪費する長すぎる積分の両方を避けたいと思います。
付録A.3では、あなたが言及した軌道倍増のようなものについて説明しています。
また、反復ごとに軌跡の長さを2倍にして、対応するサンプリング状態z '〜T(z' | t)でサンプリングされた軌跡t〜T(t | z)= U T2Lを生成することにより、より速く展開することもできます。この場合、すべての反復における古い軌道成分と新しい軌道成分の両方が、完全な順序付けされた二分木の葉に相当します(図37)。これにより、新しい軌跡コンポーネントを再帰的に構築し、再帰の各ステップでサンプルを伝播できます...
A.4でこれを拡張し、動的実装について説明します(セクションA.3は静的実装について説明します)。
幸いなことに、A.3で説明した効率的な静的スキームを繰り返して、対応するエネルギーレベルセットを十分に探索するのに十分な長さの軌道がいつ成長したかを判断する基準を選択したら、動的実装を実現できます。
重要なのは、そのダブルジャンプを行わず、基準が満たされるまで提案されたジャンプの長さを2倍にする手法を使用して次のジャンプを計算することです。少なくともそれは私がこれまでのところ論文を理解する方法です。