個々のデータセットでボックスコックス変換を使用すると、これらのデータを比較できなくなりますか？

ソフトウェア作成者が推奨するように、ボックスコックス変換を使用してデータを正規化し、生態学的ニッチ因子分析ソフトウェアに入力しました。

しかし、ボックスコックス変換メソッドが（明らかに！）変換ごとに異なるラムダ値を選択していることに気付きました。たとえば、4つのサンプル日付の個々の場所に対する因子A、B、およびCの影響を比較したいとします。各因子は個別にボックスコックス化されています（他の因子および他の日付とは別に）。これは、各変換に異なるラムダ値を選択しているため、各因子分析の結果が比較できない（そして、ANOVAなどによる変換データの単純な比較ができない）ことを意味しますか？

はいそれらが異なるスケールにある場合、それらを論理的に比較することはできません。パワー変換は単調なので、変換はすべて同じでした。ただし、サンプルの分散は変換のために変化するため、それを考慮する必要があります。しかし、あなたの状況ではそれらを比較することはできません。