最近、MCMCアルゴリズム(実際にはRの関数MCMCglmm)を使用して、ベイジアンフレームワークで回帰混合モデルの適合に着手しました。
推定プロセスの収束を診断する方法を理解したと思います(トレース、gewekeプロット、自己相関、事後分布...)。
ベイジアンフレームワークで私を襲ったことの1つは、それらの診断を行うために多くの努力が注がれているように思えるのに対し、近似モデルの残差のチェックに関してはほとんど行われていないように見えることです。たとえば、MCMCglmmでは、residual.mcmc()関数は存在しますが、実際にはまだ実装されていません(つまり、戻り値:「MCMCglmmオブジェクトにはまだ実装されていない残差」。predict.mcmc()にも同じ話があります)。他のパッケージにも欠けているようで、より一般的には、私が見つけた文献ではほとんど議論されていません(非常に頻繁に議論されているDICは別として)。
誰かが私にいくつかの便利なリファレンス、そして理想的には私が遊んだり修正したりできるRコードを教えてくれますか?
どうもありがとう。