Rでの効果の測定のために2乗したオメガ？

私が読んでいる統計の本は、私の実験の効果を測定するためにオメガ二乗を推奨しています。私は、分割プロット計画（被験者内と被験者間設計の混合）を使用して、被験者内係数がp <0.001およびF = 17で統計的に有意であることをすでに証明しています。

今、私は違いがどれほど大きいかを探しています... R（またはpython？私は知っています...夢を見ることができます;）のどこかにオメガの2乗の実装がありますRに関連するものをインターネットで検索すると痛み*は、私はCでものを見つけるために管理する方法がわかりません

ありがとう！

オメガ2乗を計算する関数は、簡単に記述できます。この関数は、aovテストによって返されたオブジェクトを取り、計算して返し、オメガ二乗します。

omega_sq <- function(aovm){
    sum_stats <- summary(aovm)[[1]]
    SSm <- sum_stats[["Sum Sq"]][1]
    SSr <- sum_stats[["Sum Sq"]][2]
    DFm <- sum_stats[["Df"]][1]
    MSr <- sum_stats[["Mean Sq"]][2]
    W2 <- (SSm-DFm*MSr)/(SSm+SSr+MSr)
    return(W2)
}

編集：nウェイaovモデルの更新された関数：

omega_sq <- function(aov_in, neg2zero=T){
    aovtab <- summary(aov_in)[[1]]
    n_terms <- length(aovtab[["Sum Sq"]]) - 1
    output <- rep(-1, n_terms)
    SSr <- aovtab[["Sum Sq"]][n_terms + 1]
    MSr <- aovtab[["Mean Sq"]][n_terms + 1]
    SSt <- sum(aovtab[["Sum Sq"]])
    for(i in 1:n_terms){
        SSm <- aovtab[["Sum Sq"]][i]
        DFm <- aovtab[["Df"]][i]
        output[i] <- (SSm-DFm*MSr)/(SSt+MSr)
        if(neg2zero & output[i] < 0){output[i] <- 0}
    }
    names(output) <- rownames(aovtab)[1:n_terms]

    return(output)
}

私は最近報告しなければなりませんでした。$\omega^2$

partialOmegas <- function(mod){
    aovMod <- mod
    if(!any(class(aovMod) %in% 'aov')) aovMod <- aov(mod)
    sumAov     <- summary(aovMod)[[1]]
    residRow   <- nrow(sumAov)
    dfError    <- sumAov[residRow,1]
    msError    <- sumAov[residRow,3]
    nTotal     <- nrow(model.frame(aovMod))
    dfEffects  <- sumAov[1:{residRow-1},1]
    ssEffects  <- sumAov[1:{residRow-1},2]
    msEffects  <- sumAov[1:{residRow-1},3]
    partOmegas <- abs((dfEffects*(msEffects-msError)) /
                  (ssEffects + (nTotal -dfEffects)*msError))
    names(partOmegas) <- rownames(sumAov)[1:{residRow-1}]
    partOmegas
}

簡単に片付けられる厄介な機能です。これは部分的な計算し、おそらく被験者間要因計画でのみ使用されるべきです。$\omega^2$

一般化されたエータの二乗は（ref、ref）より効果的なサイズの適切な尺度と見なされることをお勧めします。Rのezパッケージの ANOVA出力に含まれています。

オンラインで利用可能にした誰かの.Rprofileにオメガ二乗関数を見つけました：

http://www.estudiosfonicos.cchs.csic.es/metodolo/1/.Rprofile

Daniel "strengejacke"Lüdeckeのパッケージsjstatsは、ANOVAモデルに対してオメガ二乗、部分オメガ二乗などを行うことができません。見てみな。

以下は、そのことを示すビネットです。

https://cran.r-project.org/web/packages/sjstats/vignettes/anova-statistics.html

install.packages("sjstats")
library(sjstats)

mod1 <- aov(y~x, data= d.frame)

anova_stats(mod1)