このBeanプロット分析チャートの意味を知りたい


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Beanプロットチャートをどのように解釈および生成するか。Walkesらの例を1つ示します。2010。どのようなデータが最も役立ちますか?

豆畑
(ソース:biomedcentral.com


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「ビーンプロットは、グループ間の単変量データを視覚的に比較するための箱ひげ図の代替です。ビーンプロットでは、個々の観測値が1次元散布図に小さな線として表示されます。その隣に、分布の推定密度が表示されます平均が表示されます。」ここから抜粋。

知らない人のために:これはバイオリンのプロット(vioplot)の近親者です。

回答:


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ボックスプロットは、通常のデータ、または少なくとも単一モードのデータ用に設計されています。Beanplotは、実際の密度曲線を示します。

形状は密度であり、短い水平線は各データポイントを表します。これは、箱ひげ図、密度プロット、および敷物プロットの最高のものを1つにまとめたもので、非常に読みやすくなっています。

残念なことに、あなたが選択した例では、(私にとっては)グラフを乱雑にする長いラインをたくさん追加することにしました。[をちょきちょきと切る]

編集:beanplotでもう少し作業したので、長い太い線は各Beanの平均(またはオプションで中央値)です。細い線が長いほどデータが表示され、線が太くなるほど重複する値が増えることを示します。(私は好みに応じてそれらをジッタリングすることもできますが、少なくとも「通常」カテゴリには、ジッタリングが悪化する可能性のあるかなりの密度のポイントがすでにあります。)

私はまだあなたが選んだ例はかなり乱雑であると思います、それはスタッキングの代わりにジッタリングを使用することによっておそらくクリアされるかもしれません。

豆のプロットを作るためのRパッケージを説明した紙は、素敵な読み取りです。


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+1-bean plotの記事を読んでいます。また、ハドリーウィッカムによる40年間の箱ひげ図のワーキングペーパーもお勧めします。それは、豆のプロットと同じような目標ではなく、さまざまなプロットの説明を通過します。
アンディW

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論文全体を読まないと、それは本質的に箱ひげ図の変形であるように見えます。そのため、いくつかのグループの1変量分布を比較するなど、箱ひげ図を使用する場合に使用できます。各ポイントの線を表示し、カーネル密度推定をオーバーレイします。見てみると、データ量が少ない方が情報量が多いかもしれませんが、データ量が多すぎると雑然としすぎます。最初は赤面して、それは私にはあまり地球を揺さぶるようには見えません。もっと知りたい場合は、質問を詳しく説明してください。

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