回答:
これは(少なくとも私にとっては)簡単に答えられる質問ではありませんが、私の推測では、大多数の人は(正しいアプローチであるかどうかに関係なく)使用しているプログラムのデフォルト設定を使用しています。そして、使用する平方和のタイプを知っている(そしてデフォルトの設定から逸脱している)人々は、これをメソッドで必ず言及するだろうと私はかなり確信しています。
多くの論文が、分析を実行するために使用されたプログラム/パッケージ/関数が十分に注意深く言及されていないことに個人的にもっと気づきました。これを知ることは、使用された設定を絞り込むのに役立ちます。
現時点では、分析の実行に使用された平方和のタイプを報告する論文はありませんが、出会った場合は、回答に追加します。
編集: 興味のある分野のキーワードを使用して「平方和」を追加してGoogle Scholarで検索すると、求めている論文が表示されます。たとえば、私の場合、木部の平方和の水を検索しました。その結果、このペーパーはhttp://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1469-8137.2003.00816.x/fullになりました(表1および2の脚注を参照) )。