不慣れで懐疑的な人のための線形混合効果モデルを報告する方法は?


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私はこの問題に数回遭遇しました。レビューアはLMMの使用の正当化、LMMの代わりに、またはLMMに加えて従来のテスト、および通常の線形モデルで報告するものと同様のパラメーター推定の完全な表を要求します。 。

現在、私の特定の問題は、「さまざまなモデルの主要なパラメーター推定値を含むテーブル」を要求するレビュー担当者です。私は彼らが線形モデル(t検定とp値を含む)について報告する従来のテーブルのようなものを望んでいると思いますが、この場合、分析にはネストされたモデル比較が含まれ、それぞれに含まれる各パラメーターのt検定はありませんモデルではなく、モデル比較のための単一のテストです。だから私は何をすべきかわかりません-私はレビュー担当者を満足させたいのですが、結果の評価にほとんど役立たない情報の巨大な表を必ずしも含めたいとは思いません。現在、私は単純にベータ、SE、カイ二乗、p値を報告しています。また、各モデルにどの変数が含まれていたかを明確にします。続行する方法について何か提案はありますか?

これが私が応答することを提案しているものです:

私たちは、レビュアーが、パラメーター推定値とそれに付随する統計、および特定のモデルに含まれる各変数のp値を使用して、従来の重回帰分析で報告される内容に似たものを求めていると考えています。ただし、線形混合モデル分析では、1つの追加パラメーターを使用して縮小モデルと完全モデルを比較するネストされたモデルを使用するため、テストされるパラメーターは、完全モデル(CITATION)に追加されたパラメーターのみであるため、テーブルを含めると解釈がサポートされませんより伝統的な分析と同じように結果を分析します。したがって、各分析について、推奨されるように、結果セクションの本文に、主要な統計とともに、各モデル比較でテストされたパラメーターのベータを報告します(CITATIONS)。

また、私の特定のケースでLMMを使用することの正当化を求められたとき、これは私が対応することを提案しているものです。

線形混合モデルを使用したのは、この分析により、モデル内の試行タイプ(切り替えと切り替えなしの試行)による変動性を説明できると同時に、試行が被験者内にネストされているという事実と、同じ人物からの複数の応答を説明できるためです。他の人からの応答よりも似ています。試行タイプと被験者レベルの反応時間の変動の両方を考慮に入れると、モデルのエラーが減少し、タスクパフォ​​ーマンスの影響を検出する能力が向上すると予想されました。

これを改善する方法について何か提案があれば、私はそれを感謝します。繰り返しますが、このオーディエンスは統計的に洗練されていないため、テーブルや補足データを追加しても、混乱や懐疑論が増える可能性があります。

また、LMMを使用する動機は、私が論文で見たものとは異なることに注意してください(たとえば、複数の変量効果を同時にモデル化する-私の場合、変量効果は1つだけです-参加者であり、試行タイプは固定効果です)。いくつかの一般的な論文を引用することがその助けになるかどうかはわかりません。LMMを使用する正当な理由が適切ではないため、このデータを分析する他の方法を見落とした可能性があります。


使用しているモデルについて、もう少し詳しく教えてもらえますか?どれくらい複雑ですか?レビューアが話している「さまざまなモデル」とは何ですか?原稿でネストされたモデルについて話し合っていますか?
アメーバ2017

いくつかの主要な共変量を含む縮小モデルと、同じ変数と対象の独立変数を含む完全なモデルを含むいくつかのモデル比較を報告します。私の原稿の分析的アプローチのセクションで、これがどのように機能するかを正確に説明しますが、レビュー担当者は明らかにアプローチに精通していないため、この期待は依然として重回帰に精通していることによって導かれると思います。
panpsych77 2017

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本当に問題はありません。両方のモデルのすべてのパラメーター推定値とSEを2つの個別のテーブルまたは1つのテーブルにまとめて報告し、「これらの2つのモデルで得られた尤度比検定で得られた...」という方法で報告することもできます。一連のモデル比較と、フルモデルテーブルの各固定パラメーター推定値の隣にLRT統計を報告します。例:drop1(merMod, type="chisq")
Jake Westfall

@JakeWestfall、ありがとう!私は条約がこの情報のすべてを報告するのではないという印象を受けました(LMMの報告を読んだサイキックペーパーに基づいています)が、なぜそうするのが理にかなっているのかがわかります。あなた自身の論文から、またはこれらの表をどのようにフォーマットするかについて他に例がありますか?私が仮定する通常の重回帰表と同様ですか?私には直感的に思える方法を考え出すことができますが、例を示すことは常に良いことです。
panpsych77 2017

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@ panpsych77私はレビュー中に定期的にこの情報を要求します。これは主に、完全なモデル仕様が何であるかを読者に明確に示すためです。ここでは、私が共同執筆してきた論文で、このようなテーブルをフォーマットしてきたかのカップルの例は以下のとおりです。jakewestfall.org/publications/ANES_supplement.pdfの jakewestfall.org/publications/femininity.pdf
ジェイク・ウェストフォール

回答:


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私はこれについて部分的にレビュアーの側にいます。残りのモデルを考えると、関心のあるパラメーターの効果に関心があります。関心のある単一のパラメータのみを報告する場合、結果を解釈してモデルの有効性をチェックすることは困難です。私は提供します:

  • モデルの式
  • すべての固定効果のベータ推定
  • 対応するSEおよびCI
  • 対応する検定統計量(z、t、Chi ^ 2、AIC / BICの変化、使用したものは何でも)とdf's / n's
  • 対応するp値
  • 変量効果とその相関関係のSD(必要に応じて、個別のテーブルとして)

ほとんどの古典的なジャーナルのスペースの制約により、これらの情報をオンラインの補足に入れる必要があります。

混合モデルのレポートの例はここにあります


私はしばらくの間、生物医学/心理学研究で混合モデルを報告するためのガイドラインを探していましたが、見つかりませんでした。引用可能な参考文献があれば幸いです。
mzunhammer 2017

私が見つけた唯一のガイドラインは、適切ではないと思われるオンラインチュートリアルです。先例を確立する限り、LMMを報告するRの本(Crawley)またはいくつかの心理学論文を引用するだけかもしれません。
panpsych77 2017

また、上記の元の投稿に追加した内容を読んで、それが理にかなっている場合はお知らせください。ありがとうございました!
panpsych77 2017

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上記の回答を更新しました。標準のLM分析ではなくLMM分析の使用を正当化するために使用できるもう1つの点は、反復測定を考慮する必要があるということです。これを怠ると、独立した観測の仮定に違反するためです。
mzunhammer 2017

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読者は、新しい研究を以前の研究と簡単に比較できるような方法で提示された結果を見たいと思うことがよくあります。たとえば、生存分析では、関係が統計的に限られた値であるにもかかわらず、ジャーナルは多くの場合、結果に対して単一変数関係の大きなテーブルを表示することを好みます。そのような表は、新しい患者のコホートが他のコホートと似ていることをある程度保証します。私は結果表の点でより少なくより多くを提供することに同意します。表の制限の説明は、読者に役立つ教育機能を提供します。
EdM 2017
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