経時的な傾向が曲線線形であることがわかっているアプリケーションで、混合効果モデルをスプライン項に適合させています。ただし、評価したいのは、曲線の傾向が線形性からの個別の偏差によって発生するのか、それともグループレベルのフィットが曲線に見えるようにするグループレベルの影響なのかです。JMパッケージのデータセットを退屈な再現可能な例を示します。
library(nlme)
library(JM)
data(pbc2)
fitLME1 <- lme(log(serBilir) ~ ns(year, 2), random = ~ year | id, data = pbc2)
fitLME2 <- lme(log(serBilir) ~ year, random = ~ ns(year, 2) | id, data = pbc2)
基本的に、これらのどれが私のデータにより適しているかを知りたいです。しかしによる比較anova
は私に不吉な警告を与えます:
Model df AIC BIC logLik Test L.Ratio p-value
fitLME1 1 7 3063.364 3102.364 -1524.682
fitLME2 2 9 2882.324 2932.472 -1432.162 1 vs 2 185.0399 <.0001
Warning message:
In anova.lme(fitLME1, fitLME2) :
fitted objects with different fixed effects. REML comparisons are not meaningful.
現在、最尤法を使用してこれらの種類の比較を行うことが困難であることを認識していますが、代替手段は何ですか?
2
method = "ML"または正しいフレーズが何であれ、再フィッティングを試み、警告が消えるかどうかを確認してください。
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mdewey 2016