等尺性対数比変換が、組成データを使用して、加算(alr)または中央(clr)よりも好ましいのはなぜですか?


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国勢調査データを使用して対数比変換を使用して、構成データの線形回帰を行っています。IVは構成的です(パーセントの合計は100)。DVは非構成的かつ連続的です。

alrとclrの結果は、より簡単に解釈されます。それらはすべて同じ適合度を生成します。私はalr(またはclr)を使用する傾向があります。Aitchisonはilrを「純粋な数学」アプローチとして特徴付けていますが、私の聴衆は統計学者や数学者ではありません。

私の目的が分析からの洞察を伝えることだけである場合、なぜilr(天びんあり)の解釈がはるかに難しいアプローチを採用する必要があるのですか?

私は、Aitchison、Juan Jose Egozcue、Vera Pawlosky-Glahnによる研究の山を読みましたが、議論するつもりはありません。

回答:


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マリアネスの答えに続いて、共線性の問題のためにclrは本当に適切ではありません。つまり、clr変換されたデータを使用して推論しようとすると、変数の増減を推測しようとする罠に陥る可能性があります。

比率は安定した量であるため、ilr変換はパーティションの比率に固執することでこれを解決しようとします。これらのパーティションはツリーとして表すことができます。ツリーの内部ノードは、サブツリーの幾何平均の対数比を表します。このサブツリーのログ比率は、バランスと呼ばれます。

また、これらの出版物はすべてilr変換の解釈方法に関する優れた説明があるため、これらの出版物をチェックすることもお勧めします。

http://msystems.asm.org/content/2/1/e00162-16

https://peerj.com/articles/2969/

https://elifesciences.org/content/6/e21887

これは、ツリーを指定してバランスを計算する方法の詳細を説明するIPythonノートブックです。

私はまた、scikitバイオのモジュールでこれまでどのような説明を与えたここケースあなたは好奇心インチ


出力のサイズはなぜm - 1ですか?
O.rka

機能とその値を直接関連付けることができますか?
O.rka

同型なので、m-1です。共線性の問題に直面する前に、最大でm-1のコントラストしか持てません。そして、はい、機能を特定のパーティションにリンクできるはずです。この回答を参照してください:stats.stackexchange.com/a/270203/79569
mortonjt

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clr()変換に問題があります。データを変換した後も同じ量の変数を保持しますが、clr()の場合は特異データを取得します(実際には特異共分散行列を取得します) y1 + ... yD = 0。また、ご存知かもしれませんが、一部の統計分析は単一データでは実行できません。ilr()変換は変数の数を減らすので、D次元のスペースがあったとしましょう。しかし、ilr()の後でD-1になります。その結果、変換されたデータは比率にすぎません。このペーパーを読むことをお勧めします:http : //is.muni.cz/do/rect/habilitace/1431/Hron/habilitace/15_Filzmoser_et_al__2010_.pdf


clrの有用な区別。alrはベクトルもD-1に減らします。ilr比は変数のグループ(1つまたは複数)ですが、alr比は各単一変数のもので、ベクトルの最後の変数が共通の分母です。ilrはalrが提供しない洞察を提供する可能性がありますが、私のデータでは、ほとんどのilr比率は天びんであっても直感的に理解できません。私の現在の考えは、それはあなたのデータに依存しているということです(つまり、時には、変数のグループの比率を見たい場合もあれば、そうでない場合もあります)。
Mカーニー、

-1

それがより理にかなっているので、私はALRを使用します。1つのコンポーネントをベースラインまたは参照として使用し、そのコンポーネントに関連して他のコンポーネントが何を行うかを確認します。


1
ツアーをお読みください。これは答えではなくコメントです。十分な評判が得られたらすぐに、どの投稿にもコメントできます。
フェルディ

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ALR変換は斜めの基礎です。斜めの基準でデータを分析することは非常に難しい場合があります。これを超えると、ALR変換は距離や分散などのメトリックの概念を保持せず、どの部分が分母として扱われるかを区別します。
jds 2017年

ちょうど私の最後のコメントをフォローアップするために:statsathome.com/2017/08/09/...
JDS
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