RおよびWINBUGSまたはJAGSの縦モデル

私はRを使用して、主にvia lmerとnlmeパッケージのいくつかの縦断モデルに適合させようとしました。ただし、共分散行列の従属関係モデルや因子分析モデルなど、多くの標準モデルが不足しているようです。これらのモデルはSASですぐに利用できます。

誰かがRでの仕事に他のパッケージを勧めますか？モデリングの柔軟性が高まっている限り、常連客やベイジアンの世界で仕事をしていても気にしません。私はWINBUGS / JAGSでそれを行うことにも興味があります。

r jags panel-data

— アントニオペドロラモス
ソース

アドバイスするのは難しい-おそらく、リンクを投稿するか、使用したいモデルを詳細に指定する必要があります。自分でモデルを作成するため、WINBUGS / JAGSで何でも実行できます。したがって、必要なことが正確にわかっている場合は、それを実行できます。

— 好奇心旺盛な2012年

また、モデリングの柔軟性を求めるなら、間違いなくWINBUGS / JAGSをお勧めします。Rでは、彼らがあなたのために準備したものしか実行できませんが、ベイジアンでは、何でも自由に実行できます（学習時間の代償のため、モデルを十分に理解する必要があります）。

— 好奇心旺盛な2012年

私もあなたがこの質問をしたのを見ていますr-sig-mixed-models@r-project.org...クロスポストしないか、少なくともあなたがクロスポストしていることをはっきりと述べるのが最善です。（私はr-sig-mixed-modelsもっと実り多いことがわかるかもしれません。）

— ベン・ボルカー2012年

複数のデータセットがあり、さまざまな共分散構造を試してみたいと思います。適合したい単一の特定のモデルはありませんが、代わりに、SAS support.sas.com/rnd/app/papers/glimmix.pdfで

ちなみに、これはRで新しいコードを作成することよりも、この特定の統計目的に役立つパッケージを見つけることの方が多いため、Static Stack Exchangeサイトの方が良いかもしれません。。

— イテレータ2012年

回答:

BUGSの縦モデルと混合モデルについては、Ch。ベイズのアイデアとデータ分析の10。以下は、コード例を含む本のウェブサイトへのリンクです。

http://www.ics.uci.edu/~wjohnson/BIDA/BIDABook.html

— グレン
ソース

Rが「共分散行列の因子分析モデル」を持たないことの意味がわかりません。SASから再現したいものを明確にできますか？私の知る限り、これはRの多くの異なるパッケージで実現可能です。

antedependenceモデルに関しては、そこにあるブックで、Rコードと例が関連付けられているこの非常にトピックに関する第一著者のウェブサイトが。

WinBUGSがあなたに運をもたらすかどうかはわかりませんが、私は前述の教科書から始めます-従属依存モデルに信頼できるようです。:)

— イテレータ
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おそらくOPはここに共分散構造を必要としています：support.sas.com/documentation/cdl/en/statug/63033/HTML/default/… ...これらは原則的にのcorClasses機能を介して構築できますが、nlme簡単ではなく、私が知っている限りでは行われていない...

— ベン・ボルカー

SASにはRのnlmeよりもはるかに多くの共分散構造のオプションがあり、それらはすべて成熟しています。比較：support.sas.com/rnd/app/papers/glimmix.pdfとstat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/nlme/html/corClasses.html

私は上記の本にも精通していますが、私にとっては、いくつかのRコードはあるが成熟したRパッケージがない理論書に似ています。

問題ありませんが、「共分散構造のオプション」と言うのは不正確です-特定のタイプのパラメトリックモデルのパラメーターを推定する際に、共分散構造を指定するためのオプションがSASにあると思いますか？しかし、ここではあまり進歩していません。達成したいことは何ですか。私はGLMMIXのドキュメントをざっと読みました（統計的な観点からはかなり粗末です-たくさんの光沢があり、あまり数学ではありません）。本当に何をしたいですか？（続き）

— イテレータ2012年

：私はあなたがRでSEMパッケージのいずれかを使用することができ、わずかな学習曲線と、信じてlavaan、OpenMXまたはsem。私はSEMとこれらのパッケージについて学習しているだけですが、Rのlavaan他のモデリング（lm、lmer）によく似た数式構文を持っているように見えます。SEMを使用すると、共分散構造で多くのことができます。

— ウェイン
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