2x2より大きい分割表でのフィッシャーの正確検定


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2x2の分割表にのみFisherの正確検定を適用するように教えられました。

質問:

  1. フィッシャー自身がこのテストを2x2より大きいテーブルで使用することを想像していました(私は彼がテストを考案している間に、老婦人がミルクがお茶に追加されたのか、お茶がミルクに追加されたのかを推測しようとしていたのを知っています

  2. Stataを使用すると、Fisherの正確なテストを任意の分割表に使用できます。これは有効ですか?

  3. 分割表の予想セル数が5未満の場合、FETを使用することをお勧めしますか?


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フィッシャーの正確検定がどれほど優れているかを考えてみてください。stat.columbia.edu / 〜gelman / research / published / isr.pdf(セクション3.3)
Fr.

あなたは、彼らの方法は、実際には十分な速さにするためにネットワークアルゴリズムを使用していますR.にフィッシャーの正確確率検定を計算することができますstat.ethz.ch/R-manual/R-patched/library/stats/html/...を参照してください紙[メータとパテル1986]
シモーヌ

回答:


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フィッシャーの正確検定を2x2より大きいテーブルに適用する場合の唯一の問題は、計算が非常に難しくなることです。2x2バージョンは手作業でも実行可能な唯一のバージョンです。したがって、フィッシャーは計算が予想以上のものだったため、大きなテーブルでのテストを想像したことはないでしょう。

それでも、テストはどのmxnテーブルにも適用でき、StataやSPSSを含む一部のソフトウェアは機能を提供します。それでも、計算は多くの場合、モンテカルロアプローチを使用して近似されます。

はい、予想されるセル数が少ない場合、カイ二乗検定はそのような場合には適切な近似ではなくなるため、正確な検定を使用する方が適切です。


SPSSを使用してフィッシャーテストを実行する方法に関するドキュメントの入手先を教えてください。ありがとう
biostat_newbie

クロスタブの下を見てください
ロブ・ヒンドマン

ソフトウェアが今日非常に簡単に計算できることを考えると、理論的または実際的に、カイ二乗検定がフィッシャーの正確検定よりも実際に望ましい状況はありますか?
pmgjones

多くの場合、「正確な」検定はまったく正確ではなく、多くの「近似」方法は、重要度の公称レベルに近いカバレッジを持っています。例えば、Alan Agresti and Brent A. Coull(1998)「二項比率の区間推定では「近似」は「正確」よりも優れている」を参照。The American Statistician、52(2):119-126。
マールテンビュス

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フィッシャーの正確な方法で実行可能な時間枠(標準的なラップトップで1週間など)で分析できる最大の分割表のサイズはどれくらいですか?
-pir

6

MathWorldのこのページで は、計算の仕組みについて説明しています。テストはさまざまな方法で定義できることが指摘されています。

テストのP値を計算するには、依存関係を測定する何らかの基準に従ってテーブルを並べる必要があり、観測されたテーブルと同等以上の独立性を表すテーブルは、確率が加算されるテーブルです。依存関係を測定するために使用できるさまざまな基準があります。

2x2より大きいテーブルでこれがどのように行われるかを説明する他の記事やテキストを見つけることができませんでした。

この計算機は 、2列5行までのテーブルの正確なフィッシャー検定を計算します。使用する基準は、各テーブルの超幾何確率です。全体のP値は、実際のデータから計算された確率以下の確率を持つ同じ周辺合計を持つすべてのテーブルの超幾何確率の合計です。


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大きな分割表を使用してフィッシャーの正確検定を計算する他の方法を探している場合は、2x3分割表のフィッシャーの正確検定のオンライン計算機を参照してください。また、3x3の分割表用と2x4の分割表用もあります。

はい。予想される細胞数が少ない場合、可能であればカイ2乗検定の代わりにフィッシャーの正確検定を使用することをお勧めします。


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SPSSでフィッシャーの正確検定を取得するには、クロスタブで[統計=正確]オプションを使用します。大きなテーブルの正確なテットを計算する方法は、少なくとも1960年代以降です。最近のマイクロプロセッサの速度により、計算時間は重要ではなくなりました。実際、Exact Testは非常に簡単に実行できるため、あまり広く使用しないことが重要です。

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